More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2099 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  100 
 
 
859 aa  1741    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  83.72 
 
 
858 aa  1422    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  99.88 
 
 
837 aa  1697    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.43 
 
 
861 aa  792    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.46 
 
 
843 aa  881    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  47.67 
 
 
911 aa  808    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  52.06 
 
 
826 aa  815    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 
861 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  43.73 
 
 
824 aa  644    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
830 aa  632  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
830 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
859 aa  621  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
837 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
862 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
843 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
857 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  40.2 
 
 
838 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
837 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
838 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  42.51 
 
 
835 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
842 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
837 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  41.7 
 
 
846 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  41.7 
 
 
903 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
861 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  40.44 
 
 
837 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
829 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
801 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
770 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
782 aa  337  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
798 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
787 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
770 aa  181  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  27.79 
 
 
773 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  39.39 
 
 
508 aa  164  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 
754 aa  164  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
383 aa  164  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
676 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
640 aa  162  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 
973 aa  159  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  29.67 
 
 
783 aa  157  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  29.67 
 
 
783 aa  157  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  30.3 
 
 
774 aa  157  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
582 aa  156  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.86 
 
 
1046 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
523 aa  156  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
885 aa  155  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
784 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
1138 aa  154  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  29.97 
 
 
771 aa  152  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
975 aa  151  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3360  two component sensor kinase/response regulator hybrid  26.15 
 
 
1282 aa  151  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  31.54 
 
 
617 aa  151  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  29.47 
 
 
771 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
687 aa  151  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
778 aa  150  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
769 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.26 
 
 
969 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
775 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
442 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
442 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
774 aa  149  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
974 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
782 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
1274 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
773 aa  147  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 
1131 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
1007 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
733 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  33.05 
 
 
603 aa  147  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
763 aa  147  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
772 aa  147  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
763 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
704 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1977 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
763 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
798 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
701 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
856 aa  146  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
389 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 
911 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
568 aa  146  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
853 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
786 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
1070 aa  145  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
769 aa  145  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  36.91 
 
 
525 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
764 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
977 aa  145  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
957 aa  144  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
1352 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
775 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
1297 aa  144  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
1350 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
456 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
934 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
708 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
769 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
833 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>