More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2060 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  99.06 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  86.79 
 
 		 213 aa  377  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  56.59 
 
 		 210 aa  231  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  51.96 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  54.59 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  52.55 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  51.02 
 
 		 211 aa  197  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  50.25 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  48.29 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  47.67 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  46.97 
 
 		 233 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  45.64 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  45.13 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  45.41 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  41.43 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  41.43 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  46.67 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  45.41 
 
 		 277 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  46.19 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  46.11 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  40.48 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  41.67 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  44.33 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  43.81 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  45.69 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  46.19 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  43.16 
 
 		 195 aa  141  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  41.08 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  44.56 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  42.49 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  42.86 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  43.37 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  44.65 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  39.49 
 
 		 201 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  37.56 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  43.33 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  38.58 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  37.28 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  32.97 
 
 		 240 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  38.86 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  33.93 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  37.65 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  32.02 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.58 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  34.52 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  34.9 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  36.63 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  32.32 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4356  methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.64 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  35.66 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4492  methyltransferase GidB  33.12 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  35.8 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4511  methyltransferase GidB  33.12 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  41.94 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  31.58 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.27 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  34.27 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  35.88 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4504  methyltransferase GidB  32.56 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.77 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  29.14 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  35.42 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  27.41 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  33.93 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  32.16 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  27.17 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  30.98 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  27.23 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  30.72 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  35.66 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  34.19 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  31.52 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  34.94 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  33.79 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  34.39 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  27.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  33.82 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  30.86 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  33.82 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  33.82 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  33.82 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  31.03 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  31.03 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  31.03 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  31.03 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  33.79 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>