More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2056 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
264 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  99.62 
 
 
264 aa  525  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  93.94 
 
 
264 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  76.05 
 
 
264 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  76.05 
 
 
264 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  74.9 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
264 aa  340  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  65.15 
 
 
265 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  59.32 
 
 
264 aa  315  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  60.08 
 
 
264 aa  314  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  59.32 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 
264 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  59.32 
 
 
264 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  58.56 
 
 
264 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  59.32 
 
 
264 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  59.32 
 
 
264 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  59.32 
 
 
264 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  58.56 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  58.17 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  57.41 
 
 
264 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  57.41 
 
 
264 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  56.27 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  55.89 
 
 
264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  57.03 
 
 
264 aa  301  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  55.89 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 
264 aa  298  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  55.13 
 
 
264 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 
264 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  56.27 
 
 
264 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  54.75 
 
 
264 aa  295  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  56.65 
 
 
264 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 
264 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  57.79 
 
 
264 aa  288  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  57.79 
 
 
264 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  52.83 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  56.33 
 
 
245 aa  275  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  50.95 
 
 
265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  55.51 
 
 
264 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  49.43 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  50.76 
 
 
263 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  50.19 
 
 
265 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  49.03 
 
 
264 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  44.49 
 
 
265 aa  251  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
262 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  46.01 
 
 
264 aa  242  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 
265 aa  241  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  45.25 
 
 
264 aa  241  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
261 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  44.87 
 
 
264 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  44.11 
 
 
264 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  48.08 
 
 
270 aa  229  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  47.15 
 
 
296 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 
260 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  46.77 
 
 
265 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 
270 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  48.47 
 
 
263 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  46.77 
 
 
282 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  38.25 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  40 
 
 
262 aa  202  4e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  41.94 
 
 
254 aa  202  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.61 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.73 
 
 
256 aa  192  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  38.19 
 
 
251 aa  192  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
253 aa  189  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.74 
 
 
251 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  39.15 
 
 
242 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  39.15 
 
 
252 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.72 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  30.71 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  33.48 
 
 
290 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  31.5 
 
 
259 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  34.48 
 
 
263 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.6 
 
 
285 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  36.32 
 
 
268 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  32.63 
 
 
232 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  31.25 
 
 
268 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  28.62 
 
 
289 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  30.15 
 
 
269 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  33.02 
 
 
286 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.06 
 
 
357 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  32.14 
 
 
263 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  31.84 
 
 
257 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 
260 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  32.91 
 
 
248 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  29.91 
 
 
257 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0823  ABC transporter related  31.54 
 
 
235 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  31.17 
 
 
280 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  31.51 
 
 
266 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  34.6 
 
 
342 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>