233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2055 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 294 aa  567  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.32 
 
 		 294 aa  564  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  96.6 
 
 		 294 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  82.25 
 
 		 292 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  83.62 
 
 		 292 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  80.89 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  70.34 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  60.9 
 
 		 300 aa  339  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  58.48 
 
 		 299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  60 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  56.75 
 
 		 298 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  56.75 
 
 		 298 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  56.75 
 
 		 298 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  56.75 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  56.75 
 
 		 298 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  58.48 
 
 		 313 aa  310  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  57.09 
 
 		 298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  58.82 
 
 		 311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  60.21 
 
 		 312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  59.52 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  57.79 
 
 		 317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  57.09 
 
 		 339 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  55.86 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  55.86 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  56.4 
 
 		 298 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  56.75 
 
 		 336 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  53.98 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  55.36 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  53.98 
 
 		 302 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  53.98 
 
 		 302 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  55.17 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  55.17 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  56.12 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  54.86 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  51.2 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 299 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  51.38 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  51.88 
 
 		 295 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  51.89 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  48.93 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  50.36 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  45.91 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  43.85 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  44.14 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  43.99 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.57 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.38 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.99 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  42.97 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  41.13 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  42.42 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  43.58 
 
 		 640 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  40.7 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.3 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.6 
 
 		 584 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  58.76 
 
 		 120 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  31.51 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  31.51 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  25.15 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  32.73 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  26.82 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  27.23 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  25 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  27.23 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  27 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  26.9 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  27 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  26.14 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1189  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>