275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2034 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  177  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  84 
 
 		 78 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  58.9 
 
 		 74 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  58.33 
 
 		 74 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  62.32 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  59.7 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  56.52 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  56.76 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  50 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  55.41 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  55.22 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  55.22 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  56.72 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  44.12 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  50 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  46.27 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  44.78 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  44.05 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  46.75 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  43.28 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  47.76 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  44.93 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  41.56 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  42.86 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  42.86 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  40.3 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  42.86 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  42.86 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  42.42 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  49.28 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  53.45 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.85 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  43.28 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  38.24 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  41.79 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  39.24 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  39.24 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  39.24 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  39.24 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  39.24 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  39.24 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  43.42 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  44.78 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  36.76 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  41.79 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  39.71 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  43.06 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  38.96 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.65 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  50 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  45.71 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.65 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  38.24 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  47.76 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.82 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  47.76 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  39.71 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  39.74 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  44.12 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  37.18 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  39.51 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  35.82 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  44.29 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  37.97 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  37.97 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  37.97 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  37.31 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  38.81 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  46.27 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  37.97 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  37.97 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  37.97 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  39.71 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  38.81 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  47.17 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  37.97 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  41.18 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  37.97 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  38.81 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  45.59 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  41.18 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  52.73 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.82 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  38.81 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  34.62 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>