45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1996 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  90.61 
 
 		 347 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  62 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  57 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  57 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  59.86 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  62.59 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  46.36 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  46.82 
 
 		 323 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  45.54 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  44.1 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  45.62 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  43.26 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  47.44 
 
 		 317 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  45.03 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  46.71 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  43.39 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  41.3 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  44.18 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  44.18 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  43.49 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  44.86 
 
 		 316 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  40.32 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  42.67 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  33.22 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  33.78 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  33.49 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  32.48 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  26.64 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  27.99 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  30.38 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  31.6 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  31.6 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  27.48 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  33.47 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  29.61 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  27.73 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  23.35 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  26.32 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  25.36 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  24.17 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  23.26 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  23.26 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>