54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1995 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  75.62 
 
 		 302 aa  340  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  47.45 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  49.44 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  44.28 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  45.16 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  44.56 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  45.88 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  43.85 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  44.51 
 
 		 241 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  43.98 
 
 		 241 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  44.94 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  40.98 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  47.06 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  41.58 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  41.94 
 
 		 221 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  40.7 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  40.53 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  42.37 
 
 		 245 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  38.33 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  42.86 
 
 		 283 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  38.76 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  40.35 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  42.47 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  33.67 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  35.8 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  34.36 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  34.27 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  34.35 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  32.24 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  34.03 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  31.75 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  30.68 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  28.98 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  28.98 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  32.88 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3327  protein of unknown function DUF218  25.74 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  26.56 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  26.04 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  24.2 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  24.2 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  31.93 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  29.32 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  28.66 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  22.05 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.33 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  26.06 
 
 		 207 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  25.93 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  31.18 
 
 		 244 aa  42  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  28.95 
 
 		 199 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  24.26 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>