195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1992 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  100 
 
 		 194 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  100 
 
 		 96 aa  186  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  92.71 
 
 		 114 aa  178  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  80 
 
 		 96 aa  136  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  76.04 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  76.6 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  77.08 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  61.29 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  61.18 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  55.91 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  60.47 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  62.35 
 
 		 96 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  57.47 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  62.2 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  61.18 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  62.2 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  52.44 
 
 		 96 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  61.76 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  57.33 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  60 
 
 		 100 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  48.81 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  55.07 
 
 		 96 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  62.67 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  48.75 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  47.44 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  47.89 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  54.84 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  55.38 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  64.15 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  53.16 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  42.86 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  41.57 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  38.1 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  36.96 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  40 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  40 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  40 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  40 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  38.36 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  47.27 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  36.56 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  40 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  39.56 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  36.71 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  39.56 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  39.53 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  32.97 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  35.82 
 
 		 184 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  33.7 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  37.33 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  41.43 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  37.33 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 192 aa  50.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  35.96 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  36 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  35.44 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  36 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  36 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  36 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  40.24 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  36 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>