More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1896 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  100 
 
 		 433 aa  850    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  93.76 
 
 		 433 aa  781    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1824  ammonium transporter  78.75 
 
 		 359 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  62.16 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  63.13 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  63.13 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  63.13 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  63.13 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  63.13 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  63.2 
 
 		 431 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  63.13 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  63.13 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  62.89 
 
 		 469 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  61.45 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  61.45 
 
 		 500 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  61.57 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  60.96 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  60.96 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  60.96 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  60 
 
 		 501 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  62.65 
 
 		 499 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  60.05 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  61.15 
 
 		 438 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  62.41 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  61.15 
 
 		 438 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  59.04 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  62.5 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  59.1 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  65.93 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  61.2 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  61.2 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  54.94 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  62.44 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  60.69 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  61.38 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  61.84 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  61.35 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  63.22 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  53.75 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  60.97 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  57.04 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  54.04 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  61.66 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  56.24 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  61.66 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  50.66 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  53.74 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  50.44 
 
 		 499 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  55.33 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  54.5 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  51.1 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  56.16 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  54.61 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  53.27 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  54.99 
 
 		 436 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  50.87 
 
 		 498 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  49.13 
 
 		 500 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  51.66 
 
 		 498 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  50.77 
 
 		 498 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  57.18 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  52.56 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  51.54 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  49.67 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  52.9 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  51.3 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  51.3 
 
 		 437 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  56.49 
 
 		 433 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  50.55 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  51.06 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  51.52 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  51.52 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  54.63 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0177  ammonium transporter  53.05 
 
 		 436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000694522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  52.04 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  52.78 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  49.2 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.83 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  50.23 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  50.69 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  53.4 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  50.11 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  53.61 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  50.46 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  50.34 
 
 		 524 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  53.54 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  53.32 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  53.48 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  50.69 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  49.19 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  53.68 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  49.89 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  50.56 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  50.12 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  51.38 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  51.02 
 
 		 480 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  51.38 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  51.38 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  51.84 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  52.81 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  52.09 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>