More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1861 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  99.69 
 
 
651 aa  1331    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
651 aa  1333    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  49.53 
 
 
648 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  51.82 
 
 
646 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  56.51 
 
 
645 aa  714    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  53.66 
 
 
640 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  53.85 
 
 
640 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  89.4 
 
 
651 aa  1193    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  45.54 
 
 
646 aa  581  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  36.38 
 
 
687 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  37.63 
 
 
680 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  38.01 
 
 
676 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  35.91 
 
 
695 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  37.18 
 
 
681 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  37.33 
 
 
690 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  36.62 
 
 
692 aa  364  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  36.13 
 
 
665 aa  362  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  37.24 
 
 
683 aa  346  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  34.26 
 
 
697 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  33.92 
 
 
699 aa  340  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  34.11 
 
 
697 aa  340  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  33.98 
 
 
681 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  34.23 
 
 
674 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  33.73 
 
 
695 aa  335  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  33.58 
 
 
676 aa  330  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  36.15 
 
 
615 aa  293  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  35.62 
 
 
621 aa  272  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  40.75 
 
 
533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  45.97 
 
 
569 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  45.53 
 
 
656 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  47.93 
 
 
490 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  42.17 
 
 
577 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  31.95 
 
 
577 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35 
 
 
475 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35 
 
 
473 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35 
 
 
473 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.28 
 
 
517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35 
 
 
472 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  39.85 
 
 
474 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  51.1 
 
 
464 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  37.46 
 
 
475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  42.52 
 
 
581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  41.48 
 
 
503 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  40.41 
 
 
490 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  38.19 
 
 
741 aa  177  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  39.13 
 
 
475 aa  177  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  39.38 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  40.53 
 
 
440 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  40.53 
 
 
440 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  40.09 
 
 
437 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.15 
 
 
312 aa  168  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  40.08 
 
 
402 aa  167  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  41.85 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  39.57 
 
 
468 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  39.57 
 
 
447 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  41.41 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  38.43 
 
 
524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  37.82 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  30.41 
 
 
479 aa  164  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  50.62 
 
 
287 aa  163  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  38.77 
 
 
429 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  44.16 
 
 
362 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.17 
 
 
438 aa  160  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  31.54 
 
 
503 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  33.33 
 
 
477 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  28.17 
 
 
513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  33.45 
 
 
477 aa  157  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  29.51 
 
 
470 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.74 
 
 
448 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  30.05 
 
 
441 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.03 
 
 
472 aa  154  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  40 
 
 
435 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  33.33 
 
 
441 aa  153  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  35.37 
 
 
523 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  36.47 
 
 
527 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.94 
 
 
441 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  41.84 
 
 
490 aa  147  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  34.88 
 
 
429 aa  147  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  40.91 
 
 
417 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  30.79 
 
 
433 aa  146  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  30.37 
 
 
436 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  30.94 
 
 
470 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  32.18 
 
 
353 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  38.07 
 
 
460 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  45.56 
 
 
464 aa  145  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.62 
 
 
470 aa  145  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  41.58 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  29.65 
 
 
468 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  29.65 
 
 
468 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  29.65 
 
 
468 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.73 
 
 
465 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.42 
 
 
468 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  42.94 
 
 
406 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  34.63 
 
 
457 aa  142  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  39.89 
 
 
353 aa  142  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  44.23 
 
 
498 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  36.4 
 
 
386 aa  140  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  29.43 
 
 
482 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  35.29 
 
 
475 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  36.13 
 
 
429 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>