More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1814 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1814  sun protein  100 
 
 
465 aa  942    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  99.78 
 
 
465 aa  939    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  94 
 
 
453 aa  856    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  57.42 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  54.95 
 
 
456 aa  490  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.94 
 
 
470 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  53.8 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  54.27 
 
 
493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  54.01 
 
 
460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  45.7 
 
 
450 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  47.38 
 
 
450 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  45.8 
 
 
450 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  46.71 
 
 
450 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  45.58 
 
 
450 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  46.15 
 
 
450 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  45.12 
 
 
450 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  47.4 
 
 
471 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  46.09 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  45.57 
 
 
463 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  45.7 
 
 
440 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  46.77 
 
 
454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.71 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.51 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.31 
 
 
447 aa  299  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  45.37 
 
 
438 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  45.31 
 
 
438 aa  292  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  44.57 
 
 
448 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.22 
 
 
433 aa  280  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.78 
 
 
426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  40.71 
 
 
419 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  43 
 
 
438 aa  249  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.79 
 
 
443 aa  247  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  39 
 
 
422 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.86 
 
 
535 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  37.79 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.55 
 
 
410 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.05 
 
 
422 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  39.11 
 
 
424 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.56 
 
 
415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  37.67 
 
 
437 aa  212  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  32.02 
 
 
426 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  34.1 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.01 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.68 
 
 
443 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  31.71 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 
429 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  33.33 
 
 
440 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.1 
 
 
429 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  32.86 
 
 
429 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  32.86 
 
 
429 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  32.63 
 
 
429 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  30.94 
 
 
452 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.95 
 
 
444 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  30.09 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  31.59 
 
 
437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  33.25 
 
 
429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.53 
 
 
443 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  34.29 
 
 
434 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  29.71 
 
 
429 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  36.15 
 
 
421 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04057  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.41 
 
 
437 aa  179  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  32.2 
 
 
429 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.1 
 
 
449 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  29.58 
 
 
428 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  31.94 
 
 
429 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  31.94 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  31.94 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  31.94 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  31.94 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  31.94 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  32.2 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  34.37 
 
 
445 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  29.58 
 
 
428 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  32.39 
 
 
434 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  29.61 
 
 
426 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  31.19 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  34.3 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.37 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  31.95 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.96 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  29.36 
 
 
428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  32.48 
 
 
449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  29.82 
 
 
436 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  31.68 
 
 
429 aa  173  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.47 
 
 
427 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  33.85 
 
 
431 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  31.69 
 
 
429 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.08 
 
 
464 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.39 
 
 
457 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  29.39 
 
 
428 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.94 
 
 
434 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.89 
 
 
462 aa  172  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  29.41 
 
 
427 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  32.24 
 
 
443 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  35 
 
 
457 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  30.17 
 
 
435 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.69 
 
 
455 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  31.09 
 
 
451 aa  169  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  28.98 
 
 
429 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  28.98 
 
 
429 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>