158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1719 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1719  BioY family protein  100 
 
 
191 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  100 
 
 
191 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  79.58 
 
 
191 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  59.17 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  48.31 
 
 
195 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  44.07 
 
 
190 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  46.2 
 
 
203 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  47.65 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  43.05 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  41.52 
 
 
197 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  39.11 
 
 
192 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  43.43 
 
 
200 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  43.71 
 
 
206 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  39.53 
 
 
199 aa  101  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  39.66 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  39.49 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  39.87 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  40.13 
 
 
199 aa  90.9  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  40.13 
 
 
199 aa  90.9  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  36.47 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  42.94 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  38.46 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  42.45 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  34.69 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  34.18 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  33.74 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  35.36 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  34.05 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.94 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.79 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  37.17 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.71 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  38.03 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  33.55 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  39.64 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  31.58 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  32.39 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  38.85 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.71 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  33.14 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.54 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.01 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  35.26 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  35.62 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  31.9 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  39.47 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  36.36 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  41.9 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  40.91 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  45.16 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  36.31 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  35.33 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.75 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  35.4 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  48.84 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  36.63 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  42.18 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  40.68 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  31.13 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32.08 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  35.61 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  37.12 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  28.41 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  41.79 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  32.08 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  32.08 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  33.77 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  33.77 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  37.78 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.97 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  35.17 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  30.3 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  46.59 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  31.68 
 
 
215 aa  61.6  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  37.14 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  37.59 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  38.13 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  41.5 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  40.82 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  41.07 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  32.72 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.79 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  32.7 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  33.54 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  33.55 
 
 
169 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  33.55 
 
 
169 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  40 
 
 
202 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.91 
 
 
191 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  45.45 
 
 
191 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  44.94 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  31.06 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  39.07 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  37.86 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  45.21 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  32.76 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  34.38 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  40.14 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  29.79 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  36.77 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  34.94 
 
 
189 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>