More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1697 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  100 
 
 
443 aa  907    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  72.79 
 
 
435 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  99.55 
 
 
443 aa  900    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  74.13 
 
 
436 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  71.36 
 
 
439 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  97.74 
 
 
443 aa  889    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  71.89 
 
 
435 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  71.03 
 
 
435 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  65.41 
 
 
450 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  64.45 
 
 
450 aa  591  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  66.5 
 
 
450 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  66.34 
 
 
449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  66.02 
 
 
449 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  64.22 
 
 
450 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  66.1 
 
 
444 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  61.61 
 
 
446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  63.74 
 
 
442 aa  569  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  63.46 
 
 
462 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  62.19 
 
 
448 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  58.84 
 
 
443 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  57.01 
 
 
441 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  55.12 
 
 
442 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  54.11 
 
 
446 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  54.57 
 
 
442 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  55.21 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  55.21 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  53.71 
 
 
446 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  51.26 
 
 
445 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  52.29 
 
 
445 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  53.01 
 
 
444 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  52.77 
 
 
444 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  51.16 
 
 
441 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  52.77 
 
 
444 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  47.91 
 
 
453 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  49.52 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  50.12 
 
 
461 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  50.12 
 
 
462 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  46.51 
 
 
469 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  47.44 
 
 
454 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  45.62 
 
 
461 aa  355  8.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  44.96 
 
 
451 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  42.82 
 
 
450 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  35.22 
 
 
420 aa  287  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  35.45 
 
 
428 aa  256  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  35.45 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.61 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  32.79 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.89 
 
 
415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  34.26 
 
 
426 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  34.27 
 
 
425 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  34.74 
 
 
424 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  33.41 
 
 
428 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  34.87 
 
 
437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  33.88 
 
 
429 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  36.43 
 
 
438 aa  236  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  33.56 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  34.63 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.33 
 
 
421 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  35.26 
 
 
421 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  34.67 
 
 
443 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  34.02 
 
 
427 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  32.93 
 
 
427 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.1 
 
 
435 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  34.86 
 
 
408 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  35.43 
 
 
440 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  35.21 
 
 
432 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  33.66 
 
 
439 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  33.1 
 
 
445 aa  226  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  32.71 
 
 
439 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  33.87 
 
 
431 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  33.87 
 
 
433 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  33.87 
 
 
433 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  29.7 
 
 
432 aa  223  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  33.87 
 
 
463 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  32.5 
 
 
436 aa  223  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  36.11 
 
 
425 aa  222  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.87 
 
 
428 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  34.02 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  34.02 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  33.64 
 
 
463 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.89 
 
 
434 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  34.22 
 
 
441 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  33.64 
 
 
463 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  32.56 
 
 
443 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  32.93 
 
 
439 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  31.31 
 
 
432 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  32.69 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.67 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.9 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  34.33 
 
 
450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  34.74 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  34.01 
 
 
432 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  31.71 
 
 
433 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  31.25 
 
 
422 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.25 
 
 
422 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  31.48 
 
 
433 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.99 
 
 
427 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  33.64 
 
 
431 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.82 
 
 
450 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  33.33 
 
 
431 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>