More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1692 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1692  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  898    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1636  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  99.55 
 
 
448 aa  894    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1222  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  70.83 
 
 
456 aa  611  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3626  hypothetical protein  39.18 
 
 
454 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.6 
 
 
453 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3492  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.78 
 
 
491 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0309662  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3197  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.49 
 
 
492 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3168  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.54 
 
 
446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.7 
 
 
417 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  42.86 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  42.86 
 
 
345 aa  147  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6875  tRNA(Ile)-lysidine synthase  44.39 
 
 
358 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487527  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4744  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  44.2 
 
 
346 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1316  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.69 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0666  cell cycle protein  43.94 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2319  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.94 
 
 
412 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.074868  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3082  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.9 
 
 
368 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  42.22 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2413  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.11 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.37 
 
 
443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378443  normal  0.301003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4142  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  47.28 
 
 
347 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0565  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.33 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1097  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.14 
 
 
434 aa  114  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1817  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  47.28 
 
 
346 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19753  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.4 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0878  cell cycle protein MesJ  25.06 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1254  cell cycle protein MesJ, putative  28.84 
 
 
431 aa  110  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0167  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  55.43 
 
 
660 aa  110  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4841  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.71 
 
 
342 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0339142  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0689  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.64 
 
 
409 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3637  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.98 
 
 
400 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.845838  normal  0.200954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.62 
 
 
464 aa  103  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.71 
 
 
347 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  41.62 
 
 
326 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5490  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.19 
 
 
339 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.76 
 
 
342 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0978  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  29.26 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0172584  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1097  PP-loop protein  31.87 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.873661  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0779  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.5 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0526339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0282  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.94 
 
 
344 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271533  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31371  predicted protein  26.69 
 
 
484 aa  90.1  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.48 
 
 
464 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.91 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4424  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.77 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.24 
 
 
468 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0437  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.39 
 
 
349 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203685  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl673  lysidine synthetase  23.36 
 
 
398 aa  86.3  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.17 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  27.33 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.84 
 
 
509 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1608  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.98 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.19 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.77 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.86 
 
 
469 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00012547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.99 
 
 
481 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  35.96 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.65 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  36.99 
 
 
284 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0275  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  30.61 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.538522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.11 
 
 
521 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0365  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.03 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1341  hypothetical protein  31.09 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0818  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.55 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00477647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.46 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.69 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.11 
 
 
524 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.32 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.84 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.81 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.87 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.73 
 
 
442 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.87 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.89 
 
 
419 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31 
 
 
457 aa  79.7  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1620  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.89 
 
 
390 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1743  hypothetical protein  28.28 
 
 
336 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0014  hypothetical protein  25.36 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.709368  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.64 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.08 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1442  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.23 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0957  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.17 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.07 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 
682 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.51 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.77 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  34.24 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  28.51 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0589  cell cycle protein MesJ  35.45 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0620316  normal  0.254248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1088  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  31.82 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00200666  normal  0.0296865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2510  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.64 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336339  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.42 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  28.07 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2732  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.8 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.101406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  31.5 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.17 
 
 
486 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.07 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.69 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  32.43 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>