More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1654 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  100 
 
 
141 aa  287  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  98.58 
 
 
141 aa  284  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  90.07 
 
 
141 aa  261  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  75.97 
 
 
142 aa  200  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  65.93 
 
 
138 aa  189  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  59.84 
 
 
142 aa  159  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  53.38 
 
 
151 aa  153  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  55.12 
 
 
144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  54.47 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  51.47 
 
 
156 aa  144  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  52.67 
 
 
149 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  54.47 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  54.03 
 
 
143 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  54.84 
 
 
139 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  53.66 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  55.08 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  52.54 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  53.28 
 
 
165 aa  137  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  55.28 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  55.28 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  55.28 
 
 
142 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  52.71 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  51.22 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  50.41 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  55.08 
 
 
135 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  50.41 
 
 
137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  53.39 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  48.78 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  46.51 
 
 
140 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  47.11 
 
 
158 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  47.97 
 
 
137 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  47.15 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  47.15 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  45.38 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  42.64 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  43.41 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  41.54 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  43.41 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  43.41 
 
 
134 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  40.77 
 
 
135 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  42.64 
 
 
134 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  43.85 
 
 
139 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  42.97 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  42.64 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  42.97 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 
146 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  41.09 
 
 
134 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
146 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  40.46 
 
 
136 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  41.41 
 
 
135 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  39.84 
 
 
140 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  39.23 
 
 
150 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  38.76 
 
 
148 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  38.76 
 
 
148 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  41.54 
 
 
136 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  38.76 
 
 
147 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  41.73 
 
 
143 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
150 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
150 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
150 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
150 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
150 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  40.8 
 
 
147 aa  100  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  39.53 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  38.76 
 
 
148 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  37.69 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  41.54 
 
 
142 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  37.69 
 
 
149 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 
150 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  39.23 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  37.4 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  41.41 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  36.57 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  37.98 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  37.98 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  37.21 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  37.98 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  39.23 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  42.06 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  39.2 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  39.2 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  42.06 
 
 
176 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  41.27 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  40.94 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  41.27 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 
144 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>