38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1593 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1593  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000171018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1536  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1575  hypothetical protein  98.9 
 
 
91 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2602  hypothetical protein  92.31 
 
 
91 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3075  protein of unknown function DUF1153  91.21 
 
 
91 aa  177  5e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3332  protein of unknown function DUF1153  91.21 
 
 
91 aa  177  5e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.367393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2216  hypothetical protein  92.31 
 
 
91 aa  176  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0429129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3524  hypothetical protein  90.11 
 
 
91 aa  175  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4574  protein of unknown function DUF1153  89.01 
 
 
91 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.914351  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4461  protein of unknown function DUF1153  89.01 
 
 
91 aa  168  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0864349  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4093  hypothetical protein  89.01 
 
 
91 aa  168  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5060  hypothetical protein  87.91 
 
 
91 aa  167  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.538696  normal  0.441334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5121  hypothetical protein  87.91 
 
 
91 aa  166  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6062  protein of unknown function DUF1153  86.81 
 
 
91 aa  164  3e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1308  hypothetical protein  85.71 
 
 
91 aa  163  7e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201636  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3038  hypothetical protein  85.56 
 
 
91 aa  161  2e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00723239  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1017  hypothetical protein  81.32 
 
 
91 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.448533  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0600  hypothetical protein  85.71 
 
 
91 aa  160  4e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1271  hypothetical protein  85.71 
 
 
91 aa  160  4e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0170267  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0692  hypothetical protein  85.71 
 
 
91 aa  160  4e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3847  hypothetical protein  85.71 
 
 
91 aa  160  4e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0901905  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0940  hypothetical protein  85.71 
 
 
91 aa  160  4e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539501  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1456  protein of unknown function DUF1153  85.71 
 
 
91 aa  160  8e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1937  protein of unknown function DUF1153  84.44 
 
 
91 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2185  hypothetical protein  79.76 
 
 
91 aa  147  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0687  hypothetical protein  78.65 
 
 
89 aa  145  2e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.757409  normal  0.611658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1011  hypothetical protein  81.48 
 
 
93 aa  140  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2032  hypothetical protein  66.27 
 
 
101 aa  115  2e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0041  hypothetical protein  65.82 
 
 
99 aa  115  2e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4750  hypothetical protein  55.56 
 
 
99 aa  108  2e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1507  hypothetical protein  58.44 
 
 
92 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362913  normal  0.80475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2506  hypothetical protein  53.25 
 
 
93 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1904  hypothetical protein  48.19 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2620  hypothetical protein  53.25 
 
 
92 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1278  hypothetical protein  51.95 
 
 
92 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0066  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  82.8  2e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1400  hypothetical protein  48.05 
 
 
92 aa  78.6  3e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4097  hypothetical protein  52.94 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>