88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1586 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1586    100 
 
 
1596 bp  3164  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00316607  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  87.41 
 
 
1596 bp  1570  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1531    99.62 
 
 
1595 bp  3108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  77.62 
 
 
1596 bp  129  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  77.48 
 
 
1599 bp  111  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  78.1 
 
 
1599 bp  103  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  78.13 
 
 
1527 bp  101  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  83.72 
 
 
1617 bp  89.7  2e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  77.62 
 
 
1596 bp  85.7  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  81.58 
 
 
1590 bp  79.8  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  82.52 
 
 
1596 bp  69.9  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  90.91 
 
 
1596 bp  69.9  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  84.71 
 
 
1629 bp  65.9  3e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  89.86 
 
 
1599 bp  65.9  3e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  93.02 
 
 
1581 bp  61.9  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4375  4-phytase  93.02 
 
 
1578 bp  61.9  5e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  84.81 
 
 
1602 bp  61.9  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  89.09 
 
 
1599 bp  61.9  5e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  89.09 
 
 
1629 bp  61.9  5e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  80 
 
 
1614 bp  60  2e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  94.74 
 
 
1638 bp  60  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  87.93 
 
 
1596 bp  60  2e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  91.11 
 
 
1581 bp  58  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  91.11 
 
 
1608 bp  58  8e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  83.95 
 
 
1614 bp  58  8e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  91.11 
 
 
1581 bp  58  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  84.42 
 
 
1629 bp  58  8e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  94.59 
 
 
1629 bp  58  8e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  91.11 
 
 
1581 bp  58  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  91.11 
 
 
1581 bp  58  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  91.11 
 
 
1581 bp  58  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  92.5 
 
 
1578 bp  56  3e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  94.44 
 
 
1599 bp  56  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  90.91 
 
 
1596 bp  56  3e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  90.91 
 
 
1596 bp  56  3e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  92.31 
 
 
1587 bp  54  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  90.7 
 
 
1596 bp  54  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  94.29 
 
 
1629 bp  54  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  92.31 
 
 
1599 bp  54  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  90.7 
 
 
1581 bp  54  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  90.7 
 
 
1590 bp  54  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.20375e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  87.27 
 
 
1629 bp  54  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  94.29 
 
 
1608 bp  54  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  85.71 
 
 
1596 bp  54  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5538  extracellular solute-binding protein  90.7 
 
 
1587 bp  54  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332617  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  87.27 
 
 
1629 bp  54  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  92.31 
 
 
1605 bp  54  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  87.27 
 
 
1629 bp  54  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  92.31 
 
 
1605 bp  54  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  87.27 
 
 
1629 bp  54  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  86.21 
 
 
1587 bp  52  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  86.21 
 
 
1587 bp  52  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  86.21 
 
 
1587 bp  52  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0349  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  86.21 
 
 
1587 bp  52  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.827651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  86.21 
 
 
1587 bp  52  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  86.21 
 
 
1587 bp  52  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  96.67 
 
 
1563 bp  52  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  94.12 
 
 
1608 bp  52  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  92.11 
 
 
1596 bp  52  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  92.11 
 
 
1623 bp  52  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  87.04 
 
 
1770 bp  52  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  86.21 
 
 
1587 bp  52  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  96.67 
 
 
1596 bp  52  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  86.21 
 
 
1587 bp  52  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  83.12 
 
 
1629 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  93.94 
 
 
1635 bp  50.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  93.94 
 
 
1599 bp  50.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
1608 bp  50.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  96.55 
 
 
1599 bp  50.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  82.72 
 
 
1602 bp  50.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  83.12 
 
 
1629 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  83.12 
 
 
1611 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  83.12 
 
 
1629 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  96.55 
 
 
1563 bp  50.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  91.89 
 
 
1596 bp  50.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  83.12 
 
 
1629 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  83.12 
 
 
1629 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  83.12 
 
 
1725 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0087  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  91.67 
 
 
1587 bp  48.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  82.89 
 
 
1596 bp  48.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  96.43 
 
 
1608 bp  48.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  96.43 
 
 
1641 bp  48.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  96.43 
 
 
1614 bp  48.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
1602 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0223  extracellular solute-binding protein  88.64 
 
 
1587 bp  48.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  88.64 
 
 
1596 bp  48.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3923  extracellular solute-binding protein  85 
 
 
1587 bp  48.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333304  normal  0.449349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  91.67 
 
 
1632 bp  48.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>