More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1490 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  99.68 
 
 
621 aa  1249  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  86.52 
 
 
623 aa  1072  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  53.46 
 
 
606 aa  638  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  100 
 
 
621 aa  1253  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  53.1 
 
 
629 aa  602  1e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  50.35 
 
 
609 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  47.98 
 
 
621 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  47.33 
 
 
616 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5526  ABC transporter domain protein  45.66 
 
 
587 aa  494  1e-138  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4264  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.05 
 
 
590 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  34.63 
 
 
630 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  35.07 
 
 
583 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  34.06 
 
 
613 aa  323  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  31.85 
 
 
579 aa  321  2e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  33.87 
 
 
610 aa  321  2e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
587 aa  320  4e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  33.27 
 
 
587 aa  320  4e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.55653e-06 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  34.14 
 
 
621 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  33.71 
 
 
588 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  33.59 
 
 
586 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  35.71 
 
 
577 aa  315  2e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  32.98 
 
 
614 aa  313  7e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  34.43 
 
 
636 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  33.7 
 
 
589 aa  310  6e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  32.48 
 
 
651 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  33.7 
 
 
589 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  33.7 
 
 
589 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  32.2 
 
 
589 aa  308  1e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  32.2 
 
 
589 aa  307  4e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  34.57 
 
 
578 aa  303  6e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.7 
 
 
589 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  32.17 
 
 
575 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.07 
 
 
592 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  31.56 
 
 
660 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  32.2 
 
 
583 aa  299  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  1.17282e-06 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  31.74 
 
 
642 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  33.21 
 
 
713 aa  296  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  31.01 
 
 
674 aa  290  5e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  30.85 
 
 
606 aa  290  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  32.72 
 
 
593 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  31.68 
 
 
712 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  31.68 
 
 
704 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  31.24 
 
 
591 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  33.64 
 
 
589 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  30.64 
 
 
704 aa  286  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 
577 aa  285  2e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 
588 aa  284  4e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  33 
 
 
614 aa  283  8e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  30.02 
 
 
614 aa  283  8e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  30.02 
 
 
614 aa  283  8e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.36 
 
 
588 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.55 
 
 
588 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.15 
 
 
599 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.55 
 
 
588 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
588 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.55 
 
 
584 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
588 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 
588 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  29.04 
 
 
666 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  35.13 
 
 
572 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  30.48 
 
 
590 aa  277  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  30.87 
 
 
708 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  31.15 
 
 
595 aa  276  9e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  29.2 
 
 
596 aa  273  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  30.89 
 
 
588 aa  260  5e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  30.56 
 
 
701 aa  260  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  29.41 
 
 
596 aa  257  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  33.53 
 
 
588 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  31.05 
 
 
557 aa  253  9e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  31.77 
 
 
602 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  28.39 
 
 
712 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  30.26 
 
 
557 aa  244  4e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  29.37 
 
 
553 aa  239  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.88 
 
 
549 aa  234  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  28.44 
 
 
563 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  29.03 
 
 
626 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  30.04 
 
 
615 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  28.21 
 
 
595 aa  226  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.25 
 
 
598 aa  225  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  28.3 
 
 
602 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 
561 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  28.09 
 
 
561 aa  223  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  28.09 
 
 
561 aa  223  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  27.89 
 
 
561 aa  223  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  27.32 
 
 
605 aa  223  1e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  28.09 
 
 
561 aa  223  1e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  27.89 
 
 
561 aa  223  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  27.78 
 
 
606 aa  221  2e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  27.89 
 
 
561 aa  221  4e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  27.89 
 
 
561 aa  221  4e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  27.69 
 
 
561 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  30.78 
 
 
603 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  29.14 
 
 
560 aa  214  4e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  28.47 
 
 
597 aa  214  5e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  29.5 
 
 
596 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  27.58 
 
 
639 aa  199  1e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06158e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  28.99 
 
 
608 aa  196  9e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
571 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  26.65 
 
 
636 aa  190  6e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  26.65 
 
 
634 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>