113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1369 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1369  crcB family protein  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  99.21 
 
 
270 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  52.34 
 
 
133 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  47.41 
 
 
135 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  46.08 
 
 
150 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  49.17 
 
 
157 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  47.17 
 
 
172 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  43.65 
 
 
172 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  49.12 
 
 
150 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  50.88 
 
 
160 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  46.67 
 
 
150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  42.73 
 
 
148 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  44.34 
 
 
152 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  40.74 
 
 
148 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  40.29 
 
 
150 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  38.46 
 
 
154 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  39.2 
 
 
131 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  40.91 
 
 
131 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
134 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
134 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
134 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  40.18 
 
 
179 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  38.94 
 
 
143 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  41.9 
 
 
197 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  44.64 
 
 
165 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  29.82 
 
 
306 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  36.28 
 
 
163 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  41.96 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 
127 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5116  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  35.64 
 
 
138 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  41.1 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  34.11 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  38.64 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  39.81 
 
 
135 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  35.4 
 
 
147 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  43.37 
 
 
144 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  43.96 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  39.05 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  37.5 
 
 
123 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  30.7 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  30.7 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  30.7 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  36.89 
 
 
132 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  44.26 
 
 
150 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  34.34 
 
 
126 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  30.16 
 
 
168 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  35.58 
 
 
125 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  40.24 
 
 
144 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  36.26 
 
 
149 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  36.96 
 
 
137 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.87 
 
 
137 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  35.87 
 
 
131 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  36.96 
 
 
144 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  31.46 
 
 
128 aa  48.9  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  29.41 
 
 
129 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  30.93 
 
 
133 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  31.82 
 
 
133 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
152 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  35.87 
 
 
144 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  36.17 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  28.41 
 
 
131 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  35.87 
 
 
135 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  35.82 
 
 
124 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  34.23 
 
 
134 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  30 
 
 
134 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
137 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  42.47 
 
 
126 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  29.27 
 
 
126 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
137 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
137 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  29.41 
 
 
166 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  33.73 
 
 
121 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  27.96 
 
 
124 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  26.85 
 
 
127 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  29.27 
 
 
126 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0242  Camphor resistance CrcB protein  42.59 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  34.38 
 
 
126 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  30.11 
 
 
124 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  37.1 
 
 
124 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
125 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
124 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
124 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  31.46 
 
 
193 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  26.73 
 
 
134 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  26.88 
 
 
124 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  34.78 
 
 
120 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  30.43 
 
 
124 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.93 
 
 
123 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
133 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  30.68 
 
 
132 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  32.39 
 
 
125 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  28.71 
 
 
130 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  31.63 
 
 
127 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  33.82 
 
 
150 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  29.85 
 
 
124 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>