17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1366 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  98.57 
 
 
210 aa  411  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  41.71 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  41.85 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  31.98 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  32.12 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  30.19 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  31.68 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  33.49 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  32.06 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  26.51 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  26.13 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  30.19 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.13 
 
 
430 aa  52  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3110  hypothetical protein  35.48 
 
 
112 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231374  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  28.41 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1347  hypothetical protein  25.27 
 
 
150 aa  41.2  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331737  hitchhiker  0.0000160464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>