More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1333 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1333  dedA family protein  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  99.55 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  89.09 
 
 		 220 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  46.51 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  42.22 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  42.59 
 
 		 176 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  42.59 
 
 		 176 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  42.35 
 
 		 176 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  41.32 
 
 		 176 aa  131  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  38.27 
 
 		 176 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  43.42 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  37.72 
 
 		 176 aa  125  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  46.39 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  42.61 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  39.2 
 
 		 678 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  39.2 
 
 		 678 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  40.74 
 
 		 176 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  41.45 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  39.51 
 
 		 176 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  42.37 
 
 		 173 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  33 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.25 
 
 		 676 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.6 
 
 		 254 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  39.41 
 
 		 681 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  31.13 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  31.13 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  32.79 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  31.13 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  31.13 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  31.13 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  31.31 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.95 
 
 		 668 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  31.13 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  31.13 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  31.13 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  30.23 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  32.85 
 
 		 695 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  41.07 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.26 
 
 		 664 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.24 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  39.87 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  39.87 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  37.04 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.95 
 
 		 671 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  40.52 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.73 
 
 		 684 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  34.73 
 
 		 684 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  38.46 
 
 		 641 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  36.71 
 
 		 682 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  36.71 
 
 		 682 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  32.39 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  32.39 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  32.39 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  32.39 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  32.39 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  36.13 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  36.13 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  36.14 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.6 
 
 		 469 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  29.38 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  29.38 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.94 
 
 		 438 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.97 
 
 		 662 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  36.14 
 
 		 677 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.68 
 
 		 664 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  34.19 
 
 		 179 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  42.04 
 
 		 176 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  42.04 
 
 		 176 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  29.95 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  42.04 
 
 		 176 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  33.13 
 
 		 438 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.79 
 
 		 483 aa  88.6  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.92 
 
 		 664 aa  88.2  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.53 
 
 		 438 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  33.53 
 
 		 439 aa  85.9  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  34.21 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  31.33 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  36.5 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  31.87 
 
 		 437 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  40.27 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  29.89 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.52 
 
 		 521 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  37.75 
 
 		 672 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  25.85 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  31.33 
 
 		 438 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.93 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  26.96 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  29.88 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  39.72 
 
 		 672 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  30.99 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  26.71 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.67 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.33 
 
 		 438 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>