More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1328 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1328  sulfate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00185073  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1288  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  99.28 
 
 
276 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.749605  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1856  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  92.75 
 
 
276 aa  491  1e-138  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0302339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1800  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.53 
 
 
275 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1376  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  62.36 
 
 
287 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.535753  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1410  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  61.02 
 
 
291 aa  314  1e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2767  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  61.02 
 
 
291 aa  314  1e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.774717  hitchhiker  0.00253769 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1301  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  61.02 
 
 
291 aa  314  1e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1396  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  66.95 
 
 
288 aa  313  2e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4020  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  66.67 
 
 
290 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  0.19248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2217  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.75 
 
 
290 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.404306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1182  sulfate ABC transporter, permease protein  61.28 
 
 
295 aa  303  2e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.27298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3455  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  60.25 
 
 
291 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3892  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.57 
 
 
294 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2959  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.62 
 
 
297 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1545  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.79 
 
 
302 aa  298  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3653  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2795  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2702  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2587  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1256  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000285694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2709  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2559  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2678  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2636  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.399636  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1238  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.848072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02284  hypothetical protein  58.16 
 
 
291 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2378  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.67 
 
 
339 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2074  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.58 
 
 
277 aa  295  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0230332  hitchhiker  6.41396e-23 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2578  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  57.74 
 
 
291 aa  295  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1969  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.82 
 
 
307 aa  294  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2949  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  58.58 
 
 
291 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.540526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2808  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  57.74 
 
 
291 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1285  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.17 
 
 
328 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1222  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.69 
 
 
326 aa  291  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.917674  normal  0.204361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0125  ABC type transporter  54.26 
 
 
304 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  3.64812e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4654  sulfate ABC transporter, permease protein  56.85 
 
 
283 aa  288  5e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2064  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  56.03 
 
 
291 aa  287  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1371  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  56.09 
 
 
285 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.81 
 
 
293 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1377  sulfate ABC transporter permease protein CysW  60.19 
 
 
305 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0767  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  52.96 
 
 
288 aa  286  3e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3434  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.83 
 
 
279 aa  286  3e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.384691 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3699  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysW  59.83 
 
 
279 aa  286  3e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5391  sulfate ABC transporter permease protein CysW  57.45 
 
 
289 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0310  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  53.99 
 
 
290 aa  285  6e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3558  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  53.88 
 
 
292 aa  285  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1904  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60 
 
 
278 aa  283  1e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.47228e-07  hitchhiker  1.52704e-11 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0082  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.99 
 
 
290 aa  284  1e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.518926  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0731  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.77 
 
 
283 aa  284  1e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0610  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  53.59 
 
 
298 aa  283  2e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1004  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  53.96 
 
 
288 aa  283  2e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0558  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.43 
 
 
300 aa  281  8e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1775  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  56.49 
 
 
350 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0521176  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1348  sulfate ABC transporter, permease protein  61.61 
 
 
276 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5169  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.17 
 
 
290 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4008  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  55.81 
 
 
298 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0078  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  50.96 
 
 
280 aa  280  2e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.94391  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0583  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.43 
 
 
300 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.501211  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0594  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.43 
 
 
300 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1346  putative sulfate transport ABC transporter protein  56.15 
 
 
326 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525914  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4588  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.26 
 
 
335 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2468  ABC sulfate/thiosulfate transporter, innermembrane subunit, CysW  56.49 
 
 
346 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579343  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.79 
 
 
290 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.500562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5229  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.79 
 
 
290 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.587413  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2533  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.49 
 
 
294 aa  278  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00678647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2478  sulfate ABC transporter, permease protein  59.41 
 
 
340 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1627  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.45 
 
 
334 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.486831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1198  sulfate ABC transporter, permease protein  52.52 
 
 
285 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3092  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  49.26 
 
 
293 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1634  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  52 
 
 
315 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1521  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.42 
 
 
303 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0196  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  53.23 
 
 
290 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1640  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.23 
 
 
319 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.259928  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1127  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  52.1 
 
 
285 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2547  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.24 
 
 
315 aa  275  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03670  sulfate transport protein CysW  56.08 
 
 
289 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0616363  hitchhiker  6.87295e-09 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6975  sulfate/thiosulfate permease W  51.99 
 
 
301 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1079  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.91 
 
 
292 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.871457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1580  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  52.44 
 
 
314 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43573  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1696  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  58.58 
 
 
352 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0434814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1207  sulfate ABC transporter, permease protein  58.58 
 
 
292 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0808  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  58.58 
 
 
352 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1849  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  58.58 
 
 
348 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1123  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  52.44 
 
 
314 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1603  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  52.44 
 
 
314 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0352  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  58.58 
 
 
348 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.387041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4741  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  52.48 
 
 
316 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00402264  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2336  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.49 
 
 
303 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.131408  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2016  sulfate transport system permease protein  58.58 
 
 
344 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1863  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  58.58 
 
 
344 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5076  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.41 
 
 
290 aa  274  1e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.10666  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0504  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  57.47 
 
 
293 aa  274  1e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1499  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.45 
 
 
315 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1519  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.45 
 
 
315 aa  272  4e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5477  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.48 
 
 
285 aa  272  4e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1158  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  53.65 
 
 
305 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1797  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.05 
 
 
292 aa  271  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0541213  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0868  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.35 
 
 
332 aa  271  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1392  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.81 
 
 
307 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.979503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>