More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1238 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 123 aa  246  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 123 aa  246  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1951  30S ribosomal protein S12  99.19 
 
 		 123 aa  244  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000165732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 		 202 aa  241  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0693  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 		 123 aa  239  7.999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000127901  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0661  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 		 123 aa  239  7.999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291952  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1327  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 		 123 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.0632073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 		 123 aa  239  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1425  30S ribosomal protein S12  96.75 
 
 		 123 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469141  normal  0.0235591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1683  30S ribosomal protein S12  92.68 
 
 		 123 aa  234  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  91.87 
 
 		 123 aa  229  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  91.06 
 
 		 123 aa  229  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2435  30S ribosomal protein S12  91.87 
 
 		 123 aa  227  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2157  30S ribosomal protein S12  91.87 
 
 		 123 aa  227  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.949049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2118  30S ribosomal protein S12  91.87 
 
 		 123 aa  227  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1903  30S ribosomal protein S12  91.06 
 
 		 123 aa  225  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120307  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1359  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  224  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.604164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0358  30S ribosomal protein S12  91.06 
 
 		 123 aa  224  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0968074  normal  0.576972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2290  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3453  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2213  30S ribosomal protein S12  91.06 
 
 		 123 aa  225  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5075  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  224  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27607  normal  0.189155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3672  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3189  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1540  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  224  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 123 aa  223  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  89.43 
 
 		 123 aa  222  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  221  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  221  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1349  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 123 aa  219  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  hitchhiker  0.00943336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0585  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 123 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.940946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 125 aa  216  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0271  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  214  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  213  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0239  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  213  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.981172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  213  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1950  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0753  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.263568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  210  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0801  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  209  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.208097  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 126 aa  209  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0575  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  209  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.962051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  209  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  208  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 125 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  208  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 126 aa  207  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1710  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0342  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.67081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0356  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2539  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.800309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  206  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  206  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  204  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  204  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0714  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3678  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3921  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012429  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0275  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000516158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0416  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00364585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0316  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000103775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3718  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal  0.0746879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>