184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1069 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  100 
 
 
194 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  99.48 
 
 
194 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  83.51 
 
 
195 aa  343  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  57.81 
 
 
212 aa  237  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  48.35 
 
 
194 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  48.11 
 
 
208 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  45.16 
 
 
194 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  46.24 
 
 
194 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  47.8 
 
 
187 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  49.45 
 
 
195 aa  167  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  43.09 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  43.55 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  45.36 
 
 
187 aa  161  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  41.3 
 
 
187 aa  160  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  41.3 
 
 
187 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  43.68 
 
 
208 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  44.57 
 
 
187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  42.33 
 
 
205 aa  154  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  41.62 
 
 
187 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  40.76 
 
 
191 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  42.77 
 
 
169 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  43.37 
 
 
169 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  43.72 
 
 
187 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  46.45 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  47.25 
 
 
194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  40.44 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  46.15 
 
 
195 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  39.34 
 
 
187 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  44.32 
 
 
187 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  37.57 
 
 
191 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  37.57 
 
 
191 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  39.67 
 
 
217 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  41.58 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  39.23 
 
 
191 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  38.04 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  38.46 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  39.56 
 
 
195 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0371  nitroreductase  37.5 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.408673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  41.85 
 
 
216 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2466  nitroreductase  39.57 
 
 
192 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.294476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0809  hypothetical protein  39.57 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  38.86 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2175  nitroreductase  44.83 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  32.58 
 
 
219 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  34.83 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  35.14 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  37.2 
 
 
209 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  35.87 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  34.43 
 
 
182 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  34.22 
 
 
207 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  34.43 
 
 
182 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  34.43 
 
 
182 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  34.43 
 
 
182 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  35.91 
 
 
188 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  35.96 
 
 
182 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  36.02 
 
 
195 aa  104  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  34.29 
 
 
182 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
207 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  34.71 
 
 
182 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  35.98 
 
 
185 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  37.14 
 
 
182 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  35.45 
 
 
185 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  35.39 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  35.39 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
207 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  38.04 
 
 
185 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  32.97 
 
 
186 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0695  nitroreductase  37.89 
 
 
192 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264494  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  33.33 
 
 
182 aa  101  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  38.04 
 
 
185 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  35.43 
 
 
182 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  32.43 
 
 
186 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  30.41 
 
 
198 aa  101  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  30.05 
 
 
235 aa  100  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  38.71 
 
 
186 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  37.02 
 
 
182 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  32.95 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  33.73 
 
 
182 aa  99  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  33.51 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  29.78 
 
 
219 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  37.57 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  33.71 
 
 
182 aa  97.8  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  35.58 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  31.58 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  34.13 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  32.09 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  34.91 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  34.91 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  34.13 
 
 
183 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0173  nitroreductase  33.75 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  32.93 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  32.73 
 
 
183 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  34.34 
 
 
191 aa  92  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  30.41 
 
 
183 aa  91.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>