More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1006 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  100 
 
 		 501 aa  1011    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  75.55 
 
 		 500 aa  732    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  100 
 
 		 501 aa  1011    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  50.1 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  49.7 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  51.9 
 
 		 499 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  51.08 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.89 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  52.1 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  50 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  50.41 
 
 		 493 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.01 
 
 		 510 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.98 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.5 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.9 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.82 
 
 		 508 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.2 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.84 
 
 		 522 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.37 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.39 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.76 
 
 		 538 aa  360  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.63 
 
 		 539 aa  359  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.9 
 
 		 507 aa  350  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.7 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.32 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.21 
 
 		 507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.27 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  39.62 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  38.98 
 
 		 466 aa  303  6.000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.58 
 
 		 509 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.12 
 
 		 468 aa  280  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.86 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  37.37 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  40.37 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.38 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  44.92 
 
 		 526 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  37.66 
 
 		 528 aa  253  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.49 
 
 		 513 aa  247  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.48 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.9 
 
 		 530 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.71 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.4 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.65 
 
 		 521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.04 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.43 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.42 
 
 		 490 aa  213  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.85 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.84 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.19 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.53 
 
 		 519 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.05 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.46 
 
 		 517 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.22 
 
 		 515 aa  203  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.14 
 
 		 500 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  36.31 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.26 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  35.94 
 
 		 507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.7 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.15 
 
 		 531 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.87 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.87 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.23 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.61 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.97 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.11 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.65 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  31.46 
 
 		 510 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 		 510 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  31.67 
 
 		 515 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.67 
 
 		 515 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.57 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.06 
 
 		 498 aa  196  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  30.04 
 
 		 490 aa  196  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  34.54 
 
 		 530 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  31.67 
 
 		 515 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.67 
 
 		 510 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  31.25 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  31.25 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  32.63 
 
 		 508 aa  194  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.75 
 
 		 531 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.12 
 
 		 504 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  33.72 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.82 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.73 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.09 
 
 		 567 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.05 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  31.11 
 
 		 510 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.65 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.65 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  34.84 
 
 		 496 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.43 
 
 		 502 aa  190  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  33.4 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  36.62 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  32.84 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  32.63 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.35 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>