More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0933 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  862    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  91.53 
 
 
425 aa  804    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  99.76 
 
 
425 aa  861    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  54.33 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  53.86 
 
 
424 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  53.12 
 
 
425 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  53.18 
 
 
422 aa  438  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  52.11 
 
 
424 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  44.77 
 
 
421 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  38.08 
 
 
441 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  38.26 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  36.96 
 
 
437 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  36.91 
 
 
446 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  34.8 
 
 
444 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  37.59 
 
 
441 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  36.01 
 
 
439 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  37.56 
 
 
437 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  36.95 
 
 
440 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  35.51 
 
 
459 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  34.25 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  36.3 
 
 
437 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  32.65 
 
 
440 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  33.72 
 
 
440 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  32.42 
 
 
440 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  36.01 
 
 
448 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  33.17 
 
 
437 aa  199  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  32.43 
 
 
440 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  34.72 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  33.84 
 
 
430 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  32.57 
 
 
446 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  31.62 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  28.34 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  31.27 
 
 
428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  31.07 
 
 
428 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  30.02 
 
 
426 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  31.49 
 
 
418 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  27.91 
 
 
438 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  28.78 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  27.91 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  38.43 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  32.02 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  30.57 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  27.23 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  33.57 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  38.43 
 
 
439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  31.81 
 
 
437 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  28.22 
 
 
441 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.71 
 
 
439 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  37.69 
 
 
437 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  34.8 
 
 
342 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  27.03 
 
 
475 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  29.2 
 
 
444 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.55 
 
 
442 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  37.61 
 
 
343 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  25.77 
 
 
426 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  30.41 
 
 
454 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  31.63 
 
 
427 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  31.22 
 
 
442 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  29.73 
 
 
445 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  25.26 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  31.16 
 
 
427 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  28.19 
 
 
453 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  26.37 
 
 
425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  29.98 
 
 
447 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  29.48 
 
 
422 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  28 
 
 
446 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  30.15 
 
 
448 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  28.88 
 
 
422 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  29.02 
 
 
439 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  29.98 
 
 
467 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  30.39 
 
 
420 aa  143  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  26.4 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  28.16 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  28.17 
 
 
451 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  27.47 
 
 
436 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  28.53 
 
 
430 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1246  SufBD  31.18 
 
 
426 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.03 
 
 
448 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  26.1 
 
 
444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  27.97 
 
 
435 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  29.82 
 
 
440 aa  136  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  26.07 
 
 
450 aa  136  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  30.05 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2916  SufBD protein  28.5 
 
 
360 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  27.06 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1626  sufD  31.16 
 
 
427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.23 
 
 
448 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  28.28 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  29.31 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  27.36 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  32.23 
 
 
430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.18 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  35.1 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.18 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  35.1 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.99 
 
 
423 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.18 
 
 
423 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.94 
 
 
423 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  27.48 
 
 
445 aa  126  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>