298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0748 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  58.31 
 
 
728 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  58.69 
 
 
742 aa  841    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  66.95 
 
 
731 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  76.6 
 
 
736 aa  1120    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  66.14 
 
 
735 aa  925    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  75.36 
 
 
734 aa  1109    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  100 
 
 
746 aa  1524    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  65.74 
 
 
788 aa  958    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  59.91 
 
 
721 aa  805    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  68.09 
 
 
790 aa  965    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  65.36 
 
 
733 aa  962    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  75.07 
 
 
734 aa  1107    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  65.74 
 
 
788 aa  958    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  58.31 
 
 
728 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  99.87 
 
 
746 aa  1520    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  66.52 
 
 
801 aa  956    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  67.85 
 
 
750 aa  960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  60.95 
 
 
754 aa  847    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  67.14 
 
 
733 aa  971    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  57.2 
 
 
724 aa  783    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  57.31 
 
 
724 aa  781    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  66.39 
 
 
736 aa  967    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  57.6 
 
 
727 aa  813    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  58.31 
 
 
764 aa  826    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  64.64 
 
 
759 aa  961    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  68.7 
 
 
726 aa  996    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  66.48 
 
 
741 aa  974    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  65.92 
 
 
736 aa  977    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  58.28 
 
 
722 aa  806    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  61.82 
 
 
736 aa  897    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  75.6 
 
 
754 aa  1100    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  59.22 
 
 
724 aa  885    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  66.48 
 
 
788 aa  958    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  56.88 
 
 
721 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  93.3 
 
 
764 aa  1417    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  67.09 
 
 
813 aa  972    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  58.2 
 
 
729 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  75.78 
 
 
753 aa  1115    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  67.13 
 
 
749 aa  963    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  45.34 
 
 
722 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  45.34 
 
 
722 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  44.64 
 
 
721 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  46.41 
 
 
700 aa  596  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  48.63 
 
 
727 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  46.14 
 
 
707 aa  594  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  45.83 
 
 
721 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  45.79 
 
 
720 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  45.23 
 
 
708 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  48.52 
 
 
749 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  44.93 
 
 
736 aa  589  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  47.81 
 
 
765 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  45.44 
 
 
709 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  44.54 
 
 
731 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0084  polyphosphate kinase 1  46.5 
 
 
745 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000685763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  45.49 
 
 
707 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  46.99 
 
 
745 aa  578  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  45.4 
 
 
749 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  48.64 
 
 
705 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  45.8 
 
 
721 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  44.76 
 
 
731 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  44.22 
 
 
713 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  48.89 
 
 
696 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  46.71 
 
 
691 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  44.81 
 
 
708 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  44.56 
 
 
715 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  44.27 
 
 
743 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  44.77 
 
 
713 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  45.12 
 
 
695 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  47.29 
 
 
687 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  44.74 
 
 
696 aa  571  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  46.66 
 
 
744 aa  571  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  46.39 
 
 
729 aa  572  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  45.72 
 
 
770 aa  568  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  44.08 
 
 
702 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  46.33 
 
 
762 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  44.43 
 
 
708 aa  567  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  45.36 
 
 
700 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  45.91 
 
 
731 aa  568  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  42.98 
 
 
709 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  46.06 
 
 
766 aa  566  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  45.17 
 
 
712 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  46.02 
 
 
714 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  44.9 
 
 
743 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  44.2 
 
 
720 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  45 
 
 
882 aa  563  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43.41 
 
 
714 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  42.92 
 
 
712 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  44.13 
 
 
715 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  42.65 
 
 
709 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.5 
 
 
709 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  43.11 
 
 
713 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  44.59 
 
 
760 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  44.53 
 
 
693 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  44.66 
 
 
769 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  45.2 
 
 
702 aa  555  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  47.64 
 
 
763 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  45.49 
 
 
710 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  42.59 
 
 
701 aa  552  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  43.72 
 
 
688 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  42.17 
 
 
694 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>