27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0733 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  894    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  99.77 
 
 
435 aa  891    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  29.63 
 
 
425 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  29.44 
 
 
174 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  26.67 
 
 
170 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  27.62 
 
 
182 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  29.71 
 
 
173 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  33.62 
 
 
168 aa  53.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  42.25 
 
 
156 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  31.48 
 
 
147 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  35.05 
 
 
302 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  25.65 
 
 
188 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  30.07 
 
 
175 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  34.44 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  29.73 
 
 
295 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  31.19 
 
 
165 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  26.8 
 
 
171 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  31.18 
 
 
302 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  26.67 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  35.53 
 
 
142 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  28.97 
 
 
296 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0509  hypothetical protein  36.76 
 
 
107 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  34.07 
 
 
177 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  24.72 
 
 
383 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  38.36 
 
 
181 aa  43.1  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  29.82 
 
 
365 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  26.96 
 
 
173 aa  43.1  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>