29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0730 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  100 
 
 		 316 aa  634    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0726  putative transposition protein  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  37.5 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2089  hypothetical protein  33.69 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.705545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1191  hypothetical protein  32.94 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  0.2185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  30.54 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  31.15 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  30.67 
 
 		 362 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3202  transposition protein, putative  32.43 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  27.24 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  27.56 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  26.95 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  30.12 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  26.87 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  24.62 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  25 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  25.81 
 
 		 552 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  26.47 
 
 		 562 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  25 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  24.27 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  27.27 
 
 		 550 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  23.43 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  24.24 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  24.3 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  25.97 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  25.97 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  23.08 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  23.08 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  27.04 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>