96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0589 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  100 
 
 
424 aa  860    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  61.58 
 
 
435 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  63.33 
 
 
417 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  64.02 
 
 
416 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  65.59 
 
 
420 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  64.56 
 
 
417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  60.05 
 
 
428 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  62.06 
 
 
431 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  60.72 
 
 
421 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  59.52 
 
 
421 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  61.8 
 
 
417 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  58.11 
 
 
430 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  61.15 
 
 
418 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  60.96 
 
 
421 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  54.48 
 
 
403 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  54.2 
 
 
408 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  44.36 
 
 
471 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  46.91 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  43.41 
 
 
441 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  46.08 
 
 
406 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  48.08 
 
 
380 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  43 
 
 
425 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  44.53 
 
 
407 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  44.89 
 
 
401 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  44.89 
 
 
401 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  44.64 
 
 
401 aa  309  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  44.44 
 
 
405 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  42.64 
 
 
416 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  39.35 
 
 
398 aa  288  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  45.71 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  40.81 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  40.11 
 
 
388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  43.96 
 
 
387 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  44.69 
 
 
398 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  44.69 
 
 
387 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  35.83 
 
 
450 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  33.73 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  34.97 
 
 
388 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  37.42 
 
 
379 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  36.45 
 
 
379 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  35.31 
 
 
403 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  36.83 
 
 
389 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  35.44 
 
 
382 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  35.44 
 
 
382 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  33.33 
 
 
424 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  33.98 
 
 
389 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  27.79 
 
 
382 aa  189  9e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  29.31 
 
 
369 aa  189  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  33.07 
 
 
382 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  28.1 
 
 
383 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  32.33 
 
 
385 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  33.25 
 
 
385 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33.72 
 
 
384 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  33.91 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  33.08 
 
 
385 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  33.08 
 
 
385 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  33.71 
 
 
420 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  30.33 
 
 
390 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  32.21 
 
 
400 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  29.89 
 
 
397 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  29.63 
 
 
397 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  30.62 
 
 
399 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.93 
 
 
392 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.53 
 
 
405 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  28.57 
 
 
417 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  29.83 
 
 
413 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  30.77 
 
 
411 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  24.37 
 
 
388 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  28.52 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  29.77 
 
 
400 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25.77 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  25.34 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  24.44 
 
 
312 aa  84  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  28.53 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  25.52 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  22.14 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  22.14 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  22.14 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  24.77 
 
 
562 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.93 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  22.6 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  22.75 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  22.14 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  24.59 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  24.23 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  24.23 
 
 
400 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  24.11 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  22.64 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  25.97 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  22.82 
 
 
359 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  22.14 
 
 
438 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  22.82 
 
 
346 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  25.36 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  26.04 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2593  HK97 family phage major capsid protein  22.39 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  25.29 
 
 
490 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>