More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0583 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  99.44 
 
 
724 aa  1465  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  51.9 
 
 
760 aa  704  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  52.38 
 
 
760 aa  689  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  53.86 
 
 
718 aa  751  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  53.5 
 
 
750 aa  708  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  52.08 
 
 
764 aa  685  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  51.09 
 
 
759 aa  691  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  53.23 
 
 
743 aa  677  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  51.67 
 
 
769 aa  702  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  52.36 
 
 
784 aa  691  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  50.07 
 
 
757 aa  711  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  52.33 
 
 
768 aa  726  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  52.17 
 
 
759 aa  728  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  90.53 
 
 
724 aa  1331  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  62.7 
 
 
733 aa  873  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  61.17 
 
 
728 aa  850  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
718 aa  1473  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  52.82 
 
 
744 aa  703  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  53.42 
 
 
742 aa  716  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  61.56 
 
 
707 aa  867  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  52.36 
 
 
765 aa  691  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  62.06 
 
 
736 aa  859  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  49.93 
 
 
758 aa  706  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  65.8 
 
 
714 aa  960  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  45.11 
 
 
691 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  43.91 
 
 
728 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  40.87 
 
 
779 aa  469  1e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  41.4 
 
 
776 aa  469  1e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  44.18 
 
 
741 aa  468  1e-130  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  42.36 
 
 
727 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  41.32 
 
 
728 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  44.36 
 
 
714 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  41.72 
 
 
727 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  42.86 
 
 
714 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  42.88 
 
 
734 aa  459  1e-128  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  41.54 
 
 
732 aa  461  1e-128  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  40.51 
 
 
720 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  42.46 
 
 
734 aa  452  1e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  40.85 
 
 
833 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  41.86 
 
 
770 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  41.67 
 
 
735 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  41.49 
 
 
720 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  41.58 
 
 
757 aa  441  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  40.3 
 
 
775 aa  442  1e-122  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  41.35 
 
 
712 aa  440  1e-122  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  43.82 
 
 
763 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  43.82 
 
 
730 aa  439  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  40.14 
 
 
739 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  43.87 
 
 
651 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  40.89 
 
 
750 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  43.17 
 
 
669 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  43.35 
 
 
723 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  41.04 
 
 
654 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  43.83 
 
 
656 aa  419  1e-115  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  39.37 
 
 
788 aa  406  1e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  38.35 
 
 
788 aa  402  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 
831 aa  401  1e-110  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  41.87 
 
 
796 aa  402  1e-110  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  42.06 
 
 
810 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  39.43 
 
 
712 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  39.48 
 
 
729 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  38.14 
 
 
712 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  40.66 
 
 
658 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  39.7 
 
 
763 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  41.2 
 
 
626 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  40.7 
 
 
727 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  39.31 
 
 
814 aa  362  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  39.16 
 
 
750 aa  360  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  36.15 
 
 
776 aa  357  3e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  36.45 
 
 
658 aa  358  3e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  36.66 
 
 
735 aa  357  4e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  39.86 
 
 
776 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  38.29 
 
 
815 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  36.01 
 
 
732 aa  353  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  37.18 
 
 
830 aa  353  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  38.53 
 
 
830 aa  353  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  39.78 
 
 
626 aa  353  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.83 
 
 
648 aa  350  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.79 
 
 
755 aa  349  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  36.57 
 
 
712 aa  349  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  37.02 
 
 
626 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.41 
 
 
751 aa  346  8e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  35.03 
 
 
680 aa  343  6e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  36.93 
 
 
709 aa  341  3e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 
744 aa  338  3e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  33.91 
 
 
811 aa  336  8e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 
654 aa  336  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  36.46 
 
 
692 aa  336  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  37.79 
 
 
699 aa  335  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.55 
 
 
824 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  36.55 
 
 
824 aa  333  7e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 
648 aa  329  1e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.11 
 
 
761 aa  327  4e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 
765 aa  326  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 
727 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 
618 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  35.3 
 
 
727 aa  323  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.96 
 
 
643 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.1 
 
 
646 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  36.81 
 
 
751 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>