60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0571 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0571  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  307  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0572  hypothetical protein  98.01 
 
 		 151 aa  300  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2688  hypothetical protein  68.87 
 
 		 150 aa  209  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0873  chromosomal replication initiator, DnaA-like  54.55 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1775  chromosomal replication initiator, DnaA-like  33.07 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141537  normal  0.0422167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0875  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  43.21 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  36.46 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0073  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  49.21 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1287  hypothetical protein  40.62 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0894  DnaA related protein  44.44 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0568885  normal  0.192838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1203  hypothetical protein  37.63 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.43 
 
 		 453 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.85 
 
 		 476 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  36.76 
 
 		 466 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.23 
 
 		 503 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  36.76 
 
 		 464 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  43.66 
 
 		 477 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  32.17 
 
 		 533 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.88 
 
 		 477 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.62 
 
 		 476 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  34.21 
 
 		 426 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  37.33 
 
 		 460 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.19 
 
 		 469 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  32.88 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  29.68 
 
 		 524 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.07 
 
 		 444 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.92 
 
 		 454 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  31.3 
 
 		 468 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 462 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 462 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  31.3 
 
 		 468 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 462 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 460 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 460 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  31.94 
 
 		 460 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 460 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 460 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 461 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 		 528 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  31.3 
 
 		 472 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 461 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 462 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 457 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 462 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 462 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 459 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  34.07 
 
 		 470 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  28.93 
 
 		 473 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  29.57 
 
 		 462 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.82 
 
 		 452 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.82 
 
 		 452 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  30.4 
 
 		 464 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  27.03 
 
 		 456 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.43 
 
 		 474 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0785  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.81 
 
 		 460 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 500 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.1 
 
 		 458 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.54 
 
 		 469 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  32.61 
 
 		 482 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3374  Chromosomal replication initiator DnaA domain  33.04 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>