More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0484 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  70.56 
 
 
465 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  100 
 
 
463 aa  954    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  69.05 
 
 
471 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  92.66 
 
 
468 aa  887    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  68.04 
 
 
474 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  68.25 
 
 
465 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  99.78 
 
 
463 aa  951    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  62.85 
 
 
471 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  67.21 
 
 
435 aa  608  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  63.71 
 
 
470 aa  601  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  63.15 
 
 
467 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  62.42 
 
 
476 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  62.12 
 
 
472 aa  588  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  62.12 
 
 
472 aa  587  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  61.26 
 
 
472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  61.9 
 
 
472 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  62.37 
 
 
470 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  62.28 
 
 
471 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  60.39 
 
 
472 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  62.45 
 
 
470 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  62.45 
 
 
470 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  62.66 
 
 
470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  60.3 
 
 
473 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  60.78 
 
 
471 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  59.87 
 
 
461 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  59.65 
 
 
461 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  58.37 
 
 
471 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  59.87 
 
 
461 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  57.79 
 
 
469 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  57.64 
 
 
463 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  56.49 
 
 
469 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  55.84 
 
 
469 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  56.09 
 
 
463 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  56.89 
 
 
462 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  55.87 
 
 
465 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  56.28 
 
 
469 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  56.49 
 
 
469 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  56.49 
 
 
469 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  56.93 
 
 
469 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  56.06 
 
 
469 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  56.06 
 
 
469 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  56.06 
 
 
469 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  55.84 
 
 
469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  53.33 
 
 
466 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  54.41 
 
 
470 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  54.7 
 
 
462 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  52.4 
 
 
461 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  53.28 
 
 
466 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  53.32 
 
 
462 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  53.04 
 
 
465 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  52.62 
 
 
465 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  52.62 
 
 
465 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  51.29 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  48.49 
 
 
461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  53.04 
 
 
467 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  48.37 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  47.19 
 
 
463 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  48.85 
 
 
460 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  48.99 
 
 
461 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  51.48 
 
 
459 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  45.47 
 
 
460 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  46.22 
 
 
461 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  50.23 
 
 
458 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  50.23 
 
 
458 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  45.16 
 
 
470 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  44.02 
 
 
504 aa  382  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  43.28 
 
 
473 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  43.07 
 
 
473 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  43.79 
 
 
476 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  43.79 
 
 
476 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  43.46 
 
 
481 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  43.89 
 
 
482 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  44.33 
 
 
472 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  43.09 
 
 
483 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  41.95 
 
 
476 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  43.7 
 
 
511 aa  370  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  42.08 
 
 
480 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  41.21 
 
 
475 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  41.21 
 
 
475 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  43.74 
 
 
475 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  43.67 
 
 
475 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  43.09 
 
 
483 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  41.72 
 
 
477 aa  364  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  42.36 
 
 
482 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  42.41 
 
 
475 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  43.57 
 
 
453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  42.89 
 
 
483 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  42.47 
 
 
483 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  42.42 
 
 
517 aa  359  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  42.59 
 
 
483 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  42.59 
 
 
483 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  42.68 
 
 
483 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  42.68 
 
 
483 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  42.68 
 
 
483 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  42.68 
 
 
483 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  42.68 
 
 
483 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  42.68 
 
 
483 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  45.12 
 
 
471 aa  358  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  41.34 
 
 
480 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  42.06 
 
 
483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.158411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>