More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0452 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
189 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  98.94 
 
 
189 aa  377  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  94.71 
 
 
189 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  70.22 
 
 
179 aa  264  7e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  69.27 
 
 
191 aa  261  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  67.19 
 
 
192 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  69.23 
 
 
196 aa  258  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  66.15 
 
 
192 aa  257  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  67.6 
 
 
191 aa  254  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  70.73 
 
 
190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  70.12 
 
 
190 aa  241  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  70.12 
 
 
190 aa  241  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  67.68 
 
 
189 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  67.47 
 
 
190 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  67.07 
 
 
189 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  66.05 
 
 
193 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  67.7 
 
 
201 aa  225  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  70.19 
 
 
189 aa  224  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  65.62 
 
 
189 aa  223  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  65.62 
 
 
189 aa  223  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  70.44 
 
 
189 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  65 
 
 
189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  59.12 
 
 
209 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  54.69 
 
 
188 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  56.35 
 
 
211 aa  205  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  52.6 
 
 
194 aa  201  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  54.7 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  54.94 
 
 
202 aa  194  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  54.94 
 
 
197 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  54.94 
 
 
202 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  56.79 
 
 
195 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  54.12 
 
 
186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  56.36 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  59.88 
 
 
194 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  57.41 
 
 
202 aa  185  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  58.64 
 
 
196 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  58.02 
 
 
198 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  54.32 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  51.98 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  64.44 
 
 
195 aa  177  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  55.9 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  50.72 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  48.97 
 
 
150 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 
150 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  47.95 
 
 
150 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  44.3 
 
 
149 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.174518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 
150 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 
150 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  47.95 
 
 
149 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
150 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  50.34 
 
 
148 aa  131  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
150 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  50 
 
 
150 aa  131  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
150 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  46.9 
 
 
150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 
149 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 
149 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
150 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 
150 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 
150 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 
150 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1529  50S ribosomal protein L9P  47.76 
 
 
150 aa  124  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00288476  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
149 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  47.06 
 
 
150 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 
150 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
150 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40 
 
 
147 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 
150 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  46.38 
 
 
149 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1310  50S ribosomal protein L9  49.25 
 
 
150 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  46.9 
 
 
148 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  48.25 
 
 
150 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  42.66 
 
 
149 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  43.97 
 
 
148 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  48.25 
 
 
150 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2566  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 
150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3213  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 
150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  45.59 
 
 
148 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
150 aa  118  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
150 aa  118  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
150 aa  118  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
149 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
150 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
149 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
149 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
150 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  44.93 
 
 
150 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>