204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0217 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  100 
 
 		 334 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  99.7 
 
 		 334 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  84.73 
 
 		 334 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  59.75 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  57.01 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  57.79 
 
 		 325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  55.59 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  53.21 
 
 		 339 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  52.68 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  55.13 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  51.1 
 
 		 316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  54.79 
 
 		 334 aa  325  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  52.15 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  51.23 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  50.31 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  49.69 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  48.32 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  52.58 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  46.3 
 
 		 369 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  45.99 
 
 		 368 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  46.6 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  40.7 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  40.7 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  37.61 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  38.53 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  38.53 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  40.4 
 
 		 372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  40.29 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  40.35 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 402 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  33.33 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 381 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 		 378 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  40.61 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  38.46 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  39.6 
 
 		 377 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  34.73 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  35.03 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  40.87 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  40.87 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  40.87 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  40.87 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  40.87 
 
 		 377 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  40.87 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  40.87 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.78 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  32.73 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  31.14 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  33.54 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  32.92 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  34.22 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  33.44 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.83 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  31.37 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  31.37 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  31.37 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  29.91 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.95 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  31.47 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  29.89 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  31.45 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  30.65 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  29.64 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.72 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.61 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.41 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  27.46 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  28.79 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  27.84 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.89 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  28.9 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.48 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  28.98 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.14 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  26.11 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  25.86 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>