210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0163 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  95 
 
 
140 aa  273  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  78.72 
 
 
141 aa  235  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  73.43 
 
 
143 aa  221  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  69.29 
 
 
141 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  69.29 
 
 
141 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  66.2 
 
 
143 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  66.2 
 
 
143 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  65.49 
 
 
143 aa  191  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  64.79 
 
 
144 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  64.79 
 
 
144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  63.12 
 
 
142 aa  184  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  64.96 
 
 
141 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  64.96 
 
 
141 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  64.96 
 
 
141 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  63.5 
 
 
141 aa  183  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  64.23 
 
 
141 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  62.04 
 
 
148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  62.77 
 
 
141 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  61.54 
 
 
166 aa  178  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  62.77 
 
 
141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  61.87 
 
 
143 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  59.31 
 
 
182 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  61.36 
 
 
162 aa  157  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  62.12 
 
 
167 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  52.11 
 
 
142 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  57.97 
 
 
137 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  56.12 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  54.29 
 
 
136 aa  148  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  56.12 
 
 
147 aa  148  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  53.9 
 
 
141 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  53.23 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  49.65 
 
 
155 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  49.65 
 
 
155 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  50.35 
 
 
155 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  50.83 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  46.81 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  48.39 
 
 
147 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 
147 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 
147 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 
147 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  47.58 
 
 
145 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 
147 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  46.77 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  46.77 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  46.77 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  46.77 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  46.97 
 
 
156 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  47.58 
 
 
147 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  44.36 
 
 
136 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  43.85 
 
 
158 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 
152 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  46.03 
 
 
150 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  47.29 
 
 
148 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
154 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  44.03 
 
 
137 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
146 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  45.31 
 
 
160 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  43.09 
 
 
144 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  44.35 
 
 
146 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  44.96 
 
 
158 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  44.8 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
158 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  45.93 
 
 
153 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  44.96 
 
 
158 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  44.78 
 
 
137 aa  101  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  45.11 
 
 
159 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  44.36 
 
 
156 aa  100  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  44.09 
 
 
137 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  44.09 
 
 
137 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  44.09 
 
 
137 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1531  heat shock protein Hsp20  46.34 
 
 
156 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.217499 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  44.2 
 
 
156 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  43.7 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4105  heat shock protein IbpA  43.48 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  38.85 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  42.64 
 
 
153 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  44.29 
 
 
137 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  43.31 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  44.8 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  43.08 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  44.8 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  44.8 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  44.8 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  44.8 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  42.64 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  43.85 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3145  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
182 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  43.57 
 
 
158 aa  97.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
155 aa  97.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  43.45 
 
 
149 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>