More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0147 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
871 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  57.27 
 
 
877 aa  924    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  58.05 
 
 
916 aa  931    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  58.09 
 
 
905 aa  886    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 
820 aa  723    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
910 aa  1847    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  58.9 
 
 
921 aa  978    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  99.55 
 
 
898 aa  1815    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  50.44 
 
 
904 aa  749    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  72.14 
 
 
915 aa  1226    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  57.44 
 
 
962 aa  907    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  49.16 
 
 
873 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 
882 aa  659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  43.63 
 
 
804 aa  715    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  56.72 
 
 
880 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  58.74 
 
 
888 aa  983    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  58.12 
 
 
896 aa  931    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  71.28 
 
 
880 aa  1259    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  59.87 
 
 
908 aa  994    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  56.61 
 
 
875 aa  880    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  94.04 
 
 
910 aa  1709    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 
872 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  58.37 
 
 
878 aa  922    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  57.05 
 
 
876 aa  875    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  56.72 
 
 
929 aa  896    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  60.2 
 
 
911 aa  1007    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  49.6 
 
 
858 aa  744    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 
804 aa  707    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  54.98 
 
 
877 aa  874    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  52.17 
 
 
904 aa  842    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  60.18 
 
 
882 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  60.43 
 
 
907 aa  1027    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  59.6 
 
 
910 aa  1024    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  59.54 
 
 
923 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  58.21 
 
 
907 aa  1009    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  56.21 
 
 
879 aa  917    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  50.51 
 
 
864 aa  758    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  74.43 
 
 
881 aa  1311    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  55.86 
 
 
925 aa  876    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  71.91 
 
 
908 aa  1268    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  53.05 
 
 
897 aa  845    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  70.96 
 
 
883 aa  1254    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  58.07 
 
 
916 aa  931    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  54.28 
 
 
919 aa  896    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  66.93 
 
 
914 aa  1228    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  58.67 
 
 
929 aa  900    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 
868 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 
869 aa  634  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 
870 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 
869 aa  632  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 
872 aa  626  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 
815 aa  627  1e-178  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 
891 aa  627  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 
870 aa  623  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 
870 aa  619  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 
932 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.49 
 
 
855 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.13 
 
 
872 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 
878 aa  606  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 
853 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 
856 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.35 
 
 
873 aa  602  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 
856 aa  601  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 
880 aa  602  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 
856 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.74 
 
 
859 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  44.9 
 
 
882 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.07 
 
 
863 aa  596  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 
854 aa  597  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.92 
 
 
856 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 
882 aa  596  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 
861 aa  596  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.49 
 
 
862 aa  595  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 
856 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
855 aa  595  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 
851 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 
852 aa  594  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 
882 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 
882 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 
887 aa  593  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.36 
 
 
853 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 
889 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 
862 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 
861 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 
884 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 
884 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 
861 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  45.62 
 
 
882 aa  592  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.92 
 
 
854 aa  588  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  36.58 
 
 
868 aa  587  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 
900 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 
853 aa  587  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 
892 aa  588  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
856 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 
861 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 
855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  39.66 
 
 
881 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 
856 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  40.47 
 
 
853 aa  584  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 
856 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>