32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0141 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  320  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  98.77 
 
 
179 aa  316  7e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  83.33 
 
 
162 aa  259  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  62.96 
 
 
163 aa  218  4e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  63.19 
 
 
163 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  1.51739e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  63.19 
 
 
163 aa  195  2e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  63.19 
 
 
163 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  61.96 
 
 
163 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  53.75 
 
 
168 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  50.62 
 
 
167 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  47.56 
 
 
164 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  46.95 
 
 
164 aa  144  4e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  48 
 
 
151 aa  140  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  47.56 
 
 
164 aa  139  1e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  52.63 
 
 
168 aa  138  4e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  49.38 
 
 
167 aa  137  8e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  46.06 
 
 
164 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  45.73 
 
 
164 aa  134  6e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  46.01 
 
 
164 aa  134  6e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  44 
 
 
151 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  44 
 
 
151 aa  131  4e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  44.59 
 
 
173 aa  130  8e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  46 
 
 
151 aa  130  8e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  46.05 
 
 
185 aa  128  4e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  44.67 
 
 
151 aa  128  4e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 
151 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  46.34 
 
 
164 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  43.18 
 
 
134 aa  114  8e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  44.08 
 
 
158 aa  113  1e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  34.46 
 
 
152 aa  73.2  2e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
151 aa  52  4e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  32.47 
 
 
151 aa  50.4  1e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>