195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0119 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  98.68 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  74.24 
 
 		 229 aa  324  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  65.82 
 
 		 236 aa  285  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  63.25 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  58.7 
 
 		 230 aa  280  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  58.7 
 
 		 230 aa  280  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  59.57 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  37.09 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  39.04 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  39.91 
 
 		 213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  37.28 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  38.66 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  32.3 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  36.89 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  39.02 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  37.21 
 
 		 261 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  31.45 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  36.21 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  36.21 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  34.5 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  35.12 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  35.21 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  32.31 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  33.47 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  37.37 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.85 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  37.07 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  37.89 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  33.95 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  37.09 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  37.33 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.57 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.28 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.51 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  35.17 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  32.4 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  34.72 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  35.17 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  38.86 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.98 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.49 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  34.32 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  37.82 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  36.32 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  34.91 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.86 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  30.8 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.51 
 
 		 452 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  35.98 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  36.24 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  37.99 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  31.09 
 
 		 453 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  30.9 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  31.05 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  29.87 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  29.74 
 
 		 449 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  29.69 
 
 		 710 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  29.36 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  32.5 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  28.19 
 
 		 693 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  28.57 
 
 		 689 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  28.57 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.46 
 
 		 661 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  31 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  29.91 
 
 		 724 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  30.91 
 
 		 997 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  34.82 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  31.9 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  30.29 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  29.76 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  25.54 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  30.45 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  31.96 
 
 		 652 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  31.22 
 
 		 638 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  30.28 
 
 		 692 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  33.62 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  30.41 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  31.07 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  31.55 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  31.36 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  31.36 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  30.18 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  31.5 
 
 		 578 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  30.18 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  28.04 
 
 		 670 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  30.63 
 
 		 708 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  30.25 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.27 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  30.67 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  28.02 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.33 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  28.79 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  30.23 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  29.96 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  31.03 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  29.58 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.16 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>