188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0096 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  99.62 
 
 
262 aa  520  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  90.04 
 
 
265 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  77.5 
 
 
256 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  77.18 
 
 
256 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  74.69 
 
 
253 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  74.69 
 
 
253 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  69.55 
 
 
260 aa  362  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  67.78 
 
 
243 aa  337  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  65.97 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  67.23 
 
 
244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  67.09 
 
 
243 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  68.91 
 
 
258 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  66.81 
 
 
244 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  67.84 
 
 
243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  64.94 
 
 
250 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  60 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  61.13 
 
 
251 aa  301  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  61.07 
 
 
265 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  60.66 
 
 
254 aa  291  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  55.79 
 
 
259 aa  291  9e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  66.22 
 
 
254 aa  288  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  61.18 
 
 
268 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  61.18 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  61.85 
 
 
268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  59.23 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  54.89 
 
 
239 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  53.81 
 
 
269 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  50.88 
 
 
250 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.93 
 
 
267 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  50.61 
 
 
249 aa  224  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  47.7 
 
 
270 aa  224  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  47.6 
 
 
250 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  47.35 
 
 
254 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  44.67 
 
 
252 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
248 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  44.67 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  47.11 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  51.35 
 
 
246 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  47.15 
 
 
255 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  46.75 
 
 
255 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  50 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  46.75 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  48.76 
 
 
245 aa  214  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  51.53 
 
 
239 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  51.49 
 
 
243 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  43.44 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  46.44 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  43.44 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  46.35 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.09 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  45.92 
 
 
236 aa  211  7e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  43.8 
 
 
251 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  49.13 
 
 
259 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  50.45 
 
 
245 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  46.84 
 
 
247 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  50.45 
 
 
245 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  50.45 
 
 
245 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.41 
 
 
247 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  49.79 
 
 
238 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  49.07 
 
 
248 aa  208  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  45.14 
 
 
267 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  44.31 
 
 
246 aa  208  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  50.45 
 
 
245 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  42.68 
 
 
248 aa  205  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  42.68 
 
 
248 aa  205  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  43.1 
 
 
248 aa  204  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  50.9 
 
 
248 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  50.9 
 
 
248 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  49.07 
 
 
263 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  49.76 
 
 
271 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  50.45 
 
 
248 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  50.45 
 
 
248 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  45.06 
 
 
234 aa  203  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  45.26 
 
 
246 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  45.54 
 
 
248 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  44.64 
 
 
248 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  44.64 
 
 
248 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  50.45 
 
 
248 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  42.68 
 
 
248 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  42.68 
 
 
248 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  50.45 
 
 
248 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  42.68 
 
 
248 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  50.45 
 
 
248 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  50.45 
 
 
248 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  50.45 
 
 
248 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  50.45 
 
 
248 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  42.26 
 
 
248 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  43.64 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  49.17 
 
 
243 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  48.31 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  50.99 
 
 
274 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>