More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0083 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 
201 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  99.5 
 
 
201 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  82.08 
 
 
173 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
173 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  47.53 
 
 
166 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  47.97 
 
 
154 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  45.64 
 
 
158 aa  128  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  47.59 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
155 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  43.45 
 
 
157 aa  124  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  46.58 
 
 
151 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
162 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 
154 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  45.14 
 
 
154 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
162 aa  121  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 
154 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  45.14 
 
 
154 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.36 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  44.9 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  43.84 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  43.84 
 
 
157 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
150 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.24 
 
 
160 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  43.24 
 
 
160 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 
161 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
155 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  42.36 
 
 
152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  38.78 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 
166 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.38 
 
 
161 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.94 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.94 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.94 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.94 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.94 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  40.54 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
175 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  40.69 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.21 
 
 
159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.21 
 
 
159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 
158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.5 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  40.97 
 
 
154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 
158 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  40.26 
 
 
160 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 
167 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  43.75 
 
 
154 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
165 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
160 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  37.11 
 
 
166 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
149 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 
162 aa  111  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
154 aa  111  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 
154 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  43.33 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
141 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
159 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  39.16 
 
 
149 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 
165 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  40.41 
 
 
159 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  37.58 
 
 
155 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
159 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
158 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1881  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 
147 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
175 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  38.26 
 
 
157 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.52 
 
 
453 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 
154 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 
156 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  40.54 
 
 
165 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 
166 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
155 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.14 
 
 
186 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 
155 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
158 aa  104  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 
165 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  39.33 
 
 
157 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
156 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>