More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0069 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  47.05 
 
 
1033 aa  887    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1532  DNA polymerase III, alpha subunit  45.95 
 
 
1099 aa  853    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0291245  normal  0.633763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  46.85 
 
 
1026 aa  850    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2100  DNA polymerase III, alpha subunit  47.47 
 
 
1078 aa  736    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  46.26 
 
 
1026 aa  842    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2200  DNA polymerase III, alpha subunit  50 
 
 
1197 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.846036  normal  0.413997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  46.16 
 
 
1026 aa  851    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  48.44 
 
 
1047 aa  902    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0800  error-prone DNA polymerase  44 
 
 
1075 aa  815    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.338798 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  53.69 
 
 
1082 aa  1060    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  100 
 
 
1077 aa  2215    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  38.37 
 
 
1099 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  44.19 
 
 
1031 aa  823    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3239  error-prone DNA polymerase  38.77 
 
 
1124 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.023295  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  45.72 
 
 
1109 aa  857    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  46.2 
 
 
1026 aa  841    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  43.47 
 
 
1063 aa  800    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  44.88 
 
 
1031 aa  833    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  45.41 
 
 
1071 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  45.51 
 
 
1027 aa  819    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4461  DNA polymerase III, alpha subunit  53.03 
 
 
1117 aa  1122    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4523  error-prone DNA polymerase  43.82 
 
 
1111 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  47.82 
 
 
1023 aa  881    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3466  error-prone DNA polymerase  39.35 
 
 
1124 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14636  decreased coverage  0.00222326 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  48.68 
 
 
1044 aa  871    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2255  error-prone DNA polymerase  64.9 
 
 
1175 aa  1048    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  43.61 
 
 
1072 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  43.47 
 
 
1063 aa  800    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  45.93 
 
 
1025 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1123  DNA polymerase III, alpha subunit  52.81 
 
 
940 aa  961    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  50.96 
 
 
1071 aa  982    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  45.85 
 
 
1068 aa  829    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  47.12 
 
 
1049 aa  881    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  43.47 
 
 
1063 aa  800    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0102  DNA polymerase III, alpha subunit  50.05 
 
 
994 aa  917    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  50.97 
 
 
1059 aa  1022    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  90.81 
 
 
1077 aa  2032    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4488  error-prone DNA polymerase  43.06 
 
 
1079 aa  792    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458186  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  46.67 
 
 
1040 aa  892    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  51.04 
 
 
1075 aa  969    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0445  error-prone DNA polymerase  45.22 
 
 
1084 aa  802    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  50.46 
 
 
1132 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.929723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3563  error-prone DNA polymerase  59.21 
 
 
1165 aa  1280    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.863163  normal  0.552046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1538  DNA polymerase III, alpha subunit  55.7 
 
 
1078 aa  1149    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  54.89 
 
 
1097 aa  1165    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  44.56 
 
 
1084 aa  819    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1028  pantoate-beta-alanine ligase  44.85 
 
 
1029 aa  858    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  47.59 
 
 
1049 aa  866    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1733  error-prone DNA polymerase  60.11 
 
 
1112 aa  1272    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647587  hitchhiker  0.00382273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2388  DNA polymerase III, alpha subunit  43.94 
 
 
1068 aa  806    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743991  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3164  DNA polymerase III, alpha subunit  45.34 
 
 
1195 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1903  error-prone DNA polymerase  61.96 
 
 
1110 aa  1321    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.989909  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3998  DNA polymerase III, alpha subunit  48.38 
 
 
1116 aa  989    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2666  error-prone DNA polymerase  65.58 
 
 
1164 aa  1068    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  51.06 
 
 
1087 aa  1043    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4130  error-prone DNA polymerase  45.26 
 
 
1153 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1119  DNA polymerase III, alpha subunit  58.6 
 
 
1196 aa  1060    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0282531  normal  0.883779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  39.35 
 
 
1070 aa  700    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0175  DNA polymerase III, alpha subunit  49.64 
 
 
1126 aa  1025    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2780  DNA polymerase III, alpha subunit  53.64 
 
 
1092 aa  1129    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  45.78 
 
 
1071 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  38.37 
 
 
1099 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  45.17 
 
 
1071 aa  814    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  45.44 
 
 
1071 aa  838    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3021  DNA polymerase III, alpha subunit  52.16 
 
 
1116 aa  1093    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3263  DNA polymerase III, alpha subunit  50.7 
 
 
1126 aa  1063    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  51.88 
 
 
1096 aa  1036    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  43.7 
 
 
1072 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2785  DNA polymerase III, alpha subunit  52.7 
 
 
940 aa  959    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal  0.619093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  48.41 
 
 
1025 aa  881    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02868  DNA polymerase III alpha chain  43.4 
 
 
1024 aa  811    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2014  DNA polymerase III, alpha subunit  54.36 
 
 
1096 aa  1109    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202336  normal  0.139953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  55.31 
 
 
1093 aa  1081    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  45.44 
 
 
1071 aa  837    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  52.6 
 
 
1090 aa  1030    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  45.96 
 
 
1031 aa  849    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  54.67 
 
 
1085 aa  1146    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2987  error-prone DNA polymerase  64.29 
 
 
1196 aa  1062    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  45.78 
 
 
1071 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6832  DNA polymerase III, alpha subunit  46.38 
 
 
961 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.905572  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  47.5 
 
 
1049 aa  863    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  51.45 
 
 
1053 aa  992    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  46.43 
 
 
1024 aa  849    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  43.7 
 
 
1072 aa  800    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  40.04 
 
 
1090 aa  653    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  46.65 
 
 
1026 aa  849    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4291  DNA polymerase III, alpha subunit  56.43 
 
 
1077 aa  1144    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271094  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  47.26 
 
 
1049 aa  895    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  51.25 
 
 
1059 aa  1023    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1863  DNA-directed DNA polymerase  45.47 
 
 
1030 aa  803    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0330088  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  38.37 
 
 
1099 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  46.33 
 
 
1043 aa  868    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4261  DNA polymerase III, alpha subunit  43.5 
 
 
1128 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  47.21 
 
 
1039 aa  867    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3468  DNA polymerase III, alpha subunit  58.36 
 
 
1116 aa  1227    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.822294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  45.18 
 
 
1076 aa  816    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  46.03 
 
 
1044 aa  845    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4896  DNA polymerase III, alpha subunit  44.64 
 
 
1041 aa  811    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71874  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  45.12 
 
 
1064 aa  827    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  43.47 
 
 
1063 aa  800    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>