More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0057 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  100 
 
 
387 aa  774    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  99.74 
 
 
394 aa  771    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  93.32 
 
 
389 aa  690    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  71.61 
 
 
379 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  73.85 
 
 
388 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  66.92 
 
 
384 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  72.98 
 
 
394 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  66.75 
 
 
386 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  60.59 
 
 
376 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  59.89 
 
 
370 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  59.64 
 
 
361 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  56.79 
 
 
364 aa  425  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  57.41 
 
 
394 aa  418  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  57.36 
 
 
364 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  56.36 
 
 
378 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  56.19 
 
 
375 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  59.29 
 
 
373 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  55.84 
 
 
373 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  54.43 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  58.6 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  58.87 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  55.58 
 
 
374 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  55.91 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  53.67 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  54.78 
 
 
415 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  54.36 
 
 
374 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  52.27 
 
 
382 aa  363  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  48.33 
 
 
357 aa  355  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  48.09 
 
 
354 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  55.72 
 
 
348 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  49.05 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  49.05 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  47.25 
 
 
357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  50.73 
 
 
368 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  46.83 
 
 
359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  45.22 
 
 
363 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  43.6 
 
 
363 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.15 
 
 
362 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  50.61 
 
 
360 aa  315  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  49.18 
 
 
362 aa  315  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  46.2 
 
 
363 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  45.78 
 
 
362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  48.64 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  43.78 
 
 
363 aa  312  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  46.05 
 
 
353 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  46.05 
 
 
353 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  46.22 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  46.2 
 
 
364 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  43.87 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.78 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  42.9 
 
 
362 aa  307  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.72 
 
 
362 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  44.17 
 
 
356 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  45.1 
 
 
365 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  45.24 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  56.64 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  44.23 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  46.05 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  58.54 
 
 
361 aa  301  9e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.97 
 
 
395 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  46.59 
 
 
355 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  58.94 
 
 
365 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  45.63 
 
 
356 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  43.9 
 
 
361 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  45.68 
 
 
353 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  59.59 
 
 
362 aa  299  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  59.59 
 
 
362 aa  299  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  59.35 
 
 
362 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  43.96 
 
 
363 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  55.56 
 
 
371 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  46.43 
 
 
369 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  58.13 
 
 
364 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  46.58 
 
 
353 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  46.3 
 
 
353 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  45.53 
 
 
363 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  43.24 
 
 
370 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  56.1 
 
 
362 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  43.24 
 
 
370 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  43.24 
 
 
370 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.1 
 
 
362 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  46.78 
 
 
356 aa  293  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1469  cytochrome c oxidase, heme b and copper-binding subunit, membrane-bound  41.09 
 
 
366 aa  293  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0634786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  44.24 
 
 
364 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  43.16 
 
 
364 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0204  Mrp protein  41.91 
 
 
366 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  55.33 
 
 
374 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  42.97 
 
 
360 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  55.51 
 
 
369 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  39.67 
 
 
375 aa  289  7e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  43.16 
 
 
367 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  44.96 
 
 
362 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  46.03 
 
 
362 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  43.72 
 
 
356 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1960  ATP/GTP-binding protein  40.52 
 
 
368 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  43.92 
 
 
351 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.7 
 
 
363 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.7 
 
 
363 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.7 
 
 
363 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.7 
 
 
363 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  57.55 
 
 
363 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>