238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0054 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  691    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  99.7 
 
 		 351 aa  689    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  72.51 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  46.81 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  44.44 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  42.01 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  47.14 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  42.69 
 
 		 328 aa  251  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  42.9 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  43.3 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  42.22 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  41.75 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  41 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  39.43 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  39.73 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  38.61 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  33.43 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  43.92 
 
 		 178 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  43.64 
 
 		 170 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  44.68 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  49.33 
 
 		 173 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  43.21 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  45.1 
 
 		 176 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  52.89 
 
 		 175 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  45.71 
 
 		 178 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  39.52 
 
 		 175 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  50.81 
 
 		 179 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  43.24 
 
 		 176 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  49.59 
 
 		 172 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  45.59 
 
 		 174 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  39.71 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  41.06 
 
 		 180 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  45.26 
 
 		 185 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  46.15 
 
 		 157 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  44.54 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  43.26 
 
 		 165 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  36.21 
 
 		 196 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  39.71 
 
 		 160 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  42.42 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  38.52 
 
 		 172 aa  102  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  38.61 
 
 		 176 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  38.12 
 
 		 245 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  35.76 
 
 		 177 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  36.42 
 
 		 176 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  42.52 
 
 		 159 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  39.66 
 
 		 156 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  38.35 
 
 		 166 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  41.18 
 
 		 171 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  34.59 
 
 		 184 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  40.83 
 
 		 174 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  41.53 
 
 		 191 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  36.48 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  40.83 
 
 		 174 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  41.04 
 
 		 158 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  39.39 
 
 		 164 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  43.22 
 
 		 155 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  37.96 
 
 		 154 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  37.61 
 
 		 149 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  37.4 
 
 		 170 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  37.59 
 
 		 157 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  43.48 
 
 		 158 aa  90.5  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  37.41 
 
 		 181 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  39.5 
 
 		 167 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  40.83 
 
 		 151 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  29.85 
 
 		 243 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  37.69 
 
 		 158 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  42.4 
 
 		 162 aa  87  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  36.69 
 
 		 167 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  36.76 
 
 		 156 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  39.2 
 
 		 165 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  45.95 
 
 		 165 aa  86.3  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  44.25 
 
 		 195 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  42.48 
 
 		 158 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  40.74 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  38.21 
 
 		 167 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  38.33 
 
 		 164 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  35.62 
 
 		 166 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  37.37 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  40.71 
 
 		 149 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  35.59 
 
 		 160 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  36.43 
 
 		 182 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  31.16 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  31.62 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  35.83 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.36 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  37.19 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  38.98 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  36.84 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  32 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  38.24 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  33.05 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  39.05 
 
 		 160 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  32.23 
 
 		 158 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  35.88 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  31.11 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  31.11 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>