More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0031 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0031  transglycosylase, putative  100 
 
 		 427 aa  877    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0031  putative transglycosylase  99.06 
 
 		 427 aa  869    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  88.06 
 
 		 419 aa  781    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4092  lytic murein transglycosylase  61.78 
 
 		 411 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.590731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4073  lytic murein transglycosylase  59.8 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4393  lytic murein transglycosylase  60.56 
 
 		 477 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  58.93 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0157  lytic murein transglycosylase  56.71 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6247  putative transglycosylase  43.58 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  41.08 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4124  lytic murein transglycosylase  39.76 
 
 		 414 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1924  lytic murein transglycosylase  42.93 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3393  lytic murein transglycosylase  42.97 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2907  lytic murein transglycosylase  40.15 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00384292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2140  lytic murein transglycosylase  42.51 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.074873  hitchhiker  0.00848991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2479  lytic murein transglycosylase  38.92 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0304253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  37.25 
 
 		 409 aa  263  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  39.32 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  39.41 
 
 		 445 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  35.98 
 
 		 427 aa  253  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.63 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  39.3 
 
 		 445 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 		 438 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  37.96 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  37.47 
 
 		 448 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.62 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  39.73 
 
 		 418 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  35.87 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  39.3 
 
 		 438 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  39.36 
 
 		 413 aa  243  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  37.87 
 
 		 421 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  39.53 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 		 429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  38.03 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  38.83 
 
 		 413 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  38.3 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  38.87 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  37.62 
 
 		 407 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  37.05 
 
 		 417 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  37.88 
 
 		 405 aa  236  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  36.9 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  35.65 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  35.85 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  34.26 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3558  lytic murein transglycosylase  37.66 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  36.32 
 
 		 448 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  34.48 
 
 		 422 aa  229  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  35.9 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 461 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  37.76 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  37.27 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.27 
 
 		 462 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.19 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  37.12 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.01 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  34.06 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  36.24 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35.54 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  34.26 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  38.07 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  33.79 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  35.08 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  35.41 
 
 		 437 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  38.69 
 
 		 490 aa  220  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  36.04 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  33.51 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  36.27 
 
 		 481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  33.79 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  43.45 
 
 		 491 aa  219  6e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 		 464 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 470 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  36.48 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  33.7 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  42.37 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  35.34 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  33.42 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  36.46 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  35.57 
 
 		 514 aa  216  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  36.45 
 
 		 474 aa  216  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  35.39 
 
 		 398 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.89 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 415 aa  216  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  38.99 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>