More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0010 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 
622 aa  1285    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.51 
 
 
610 aa  1255    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  89.35 
 
 
622 aa  1167    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  51.72 
 
 
622 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  50.65 
 
 
614 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  51.61 
 
 
631 aa  618  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 
638 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  49.11 
 
 
659 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  51.86 
 
 
635 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  51.69 
 
 
631 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  50.94 
 
 
670 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  50.32 
 
 
641 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  50.41 
 
 
631 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  49.92 
 
 
637 aa  594  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  49.75 
 
 
637 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  50.17 
 
 
641 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  49.03 
 
 
617 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  47.86 
 
 
605 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  49.42 
 
 
621 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  49.48 
 
 
619 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  47.88 
 
 
631 aa  568  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4446  extracellular solute-binding protein family 5  47.89 
 
 
610 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215863  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  47.16 
 
 
610 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  44.39 
 
 
600 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  47.25 
 
 
607 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  44.52 
 
 
633 aa  532  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  45.86 
 
 
603 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  45.36 
 
 
615 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  43.86 
 
 
615 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  44.32 
 
 
611 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  43.65 
 
 
611 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  44.32 
 
 
611 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 
611 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  44.35 
 
 
609 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 
613 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  42.66 
 
 
609 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  43.55 
 
 
615 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  42.66 
 
 
646 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  42.83 
 
 
590 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  43.52 
 
 
610 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
611 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  43.03 
 
 
615 aa  482  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.37 
 
 
609 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  42.17 
 
 
609 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  42.15 
 
 
616 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 
609 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
618 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  40.92 
 
 
626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  41.08 
 
 
609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.86 
 
 
618 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  41.62 
 
 
613 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  42.14 
 
 
609 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.16 
 
 
628 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 
606 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.1 
 
 
615 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 
640 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  39.94 
 
 
616 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.48 
 
 
611 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  40.34 
 
 
615 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  38.45 
 
 
602 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  39.16 
 
 
638 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 
606 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2359  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 
645 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0844875  normal  0.182874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  39.36 
 
 
630 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 
627 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0704  ABC peptide transporter, substrate binding protein  40.33 
 
 
645 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  38.93 
 
 
597 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  37.61 
 
 
658 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  38.17 
 
 
626 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  39.5 
 
 
600 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  38.21 
 
 
636 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  38.81 
 
 
625 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 
592 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.3 
 
 
614 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 
643 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  38.54 
 
 
602 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 
621 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  37.3 
 
 
602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  38.84 
 
 
627 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  37.54 
 
 
615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  38.37 
 
 
602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  38.37 
 
 
602 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 
661 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  38.28 
 
 
601 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 
626 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  37.25 
 
 
602 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1699  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 
611 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  39.25 
 
 
622 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 
622 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2633  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 
629 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.86 
 
 
654 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2501  extracellular solute-binding protein family 5  38.03 
 
 
613 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0677964  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
628 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0388  extracellular solute-binding protein family 5  38.69 
 
 
624 aa  399  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.698142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 
627 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  37.33 
 
 
632 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  38.54 
 
 
624 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 
625 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 
627 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>