More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0001 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  69.57 
 
 
516 aa  676  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  67.01 
 
 
524 aa  660  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  67.7 
 
 
479 aa  673  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0003  chromosomal replication initiation protein  92.54 
 
 
520 aa  873  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  2.73847e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  70.19 
 
 
481 aa  673  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  1.32312e-05 
 
 
-
 
NC_004310  BR0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
496 aa  1010  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00276825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  69.09 
 
 
516 aa  677  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0001  chromosomal replication initiation protein  99.8 
 
 
496 aa  1007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  8.69739e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  69.64 
 
 
524 aa  673  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  5.04678e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  51.12 
 
 
475 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  50.92 
 
 
473 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  51.12 
 
 
475 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  49.49 
 
 
475 aa  459  1e-128  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  48.68 
 
 
472 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  49.19 
 
 
472 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  49.49 
 
 
472 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  48.67 
 
 
510 aa  441  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  2.44231e-08  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  45.86 
 
 
498 aa  440  1e-122  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  48.47 
 
 
506 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  46.9 
 
 
501 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  46.49 
 
 
501 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  46.49 
 
 
501 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  48.09 
 
 
506 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  1.43408e-08 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  46.07 
 
 
494 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  45.25 
 
 
499 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.06 
 
 
519 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  1.18183e-08  unclonable  1.22456e-24 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 
482 aa  355  9e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  40.62 
 
 
448 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  40.46 
 
 
461 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  6.03983e-07 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  38.65 
 
 
460 aa  343  3e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 
455 aa  340  3e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  40.25 
 
 
455 aa  340  3e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  37.14 
 
 
464 aa  338  1e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  36.72 
 
 
452 aa  337  2e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  38.4 
 
 
470 aa  337  3e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  38.29 
 
 
477 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.27 
 
 
509 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  36.49 
 
 
460 aa  330  3e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.21 
 
 
477 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  35.79 
 
 
475 aa  308  1e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.96 
 
 
446 aa  308  1e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 
446 aa  307  2e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 
446 aa  307  2e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 
446 aa  307  2e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 
446 aa  307  2e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 
446 aa  307  2e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.08 
 
 
446 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  35.08 
 
 
446 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  36.17 
 
 
446 aa  305  1e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  35.64 
 
 
446 aa  304  2e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.66 
 
 
446 aa  303  3e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.51 
 
 
482 aa  303  4e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  4.60391e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  35.26 
 
 
450 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.9 
 
 
450 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.16 
 
 
453 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.64 
 
 
454 aa  287  3e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0001  chromosomal replication initiation protein  37.63 
 
 
487 aa  286  6e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.775334  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.72 
 
 
463 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  34.01 
 
 
451 aa  286  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.63 
 
 
453 aa  285  1e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  34.63 
 
 
453 aa  285  1e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.64 
 
 
474 aa  285  2e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  34.79 
 
 
457 aa  283  7e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  34.8 
 
 
457 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.81 
 
 
446 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  33.68 
 
 
443 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 
441 aa  275  2e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.96 
 
 
449 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  33.68 
 
 
442 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.96 
 
 
461 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 
440 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  32.58 
 
 
524 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.24 
 
 
483 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  40.87 
 
 
436 aa  267  3e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  33.13 
 
 
445 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  33.82 
 
 
452 aa  267  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  5.82235e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  35.2 
 
 
498 aa  267  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  33.48 
 
 
462 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.04 
 
 
462 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.29 
 
 
469 aa  266  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  34.46 
 
 
472 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  35.84 
 
 
468 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.7 
 
 
444 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  35.22 
 
 
495 aa  264  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.87 
 
 
453 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.46 
 
 
454 aa  263  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.54 
 
 
464 aa  263  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  42.61 
 
 
445 aa  262  9e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.2 
 
 
456 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  31.88 
 
 
452 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  33.06 
 
 
452 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 
468 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  33.06 
 
 
452 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  35.15 
 
 
451 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 
466 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 
466 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 
466 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 
466 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.8 
 
 
516 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  3.522e-07  unclonable  7.22922e-12 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  33.97 
 
 
463 aa  259  5e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>