More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A1097 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
315 aa  615  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  63.51 
 
 
315 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  39.61 
 
 
324 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  38.21 
 
 
317 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  37.87 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  31.71 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 
333 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  34.85 
 
 
311 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
325 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
359 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  35.59 
 
 
603 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  31.88 
 
 
328 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  31.51 
 
 
328 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  28.33 
 
 
335 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  32.63 
 
 
357 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.91 
 
 
609 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  33.99 
 
 
603 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  30.87 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  31.21 
 
 
334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  30.22 
 
 
616 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
338 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
326 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  28.87 
 
 
326 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  32.25 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  30.8 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1974  inner-membrane translocator  35.86 
 
 
317 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  34.64 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
339 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  33.2 
 
 
326 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  30.53 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  29.6 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  31.92 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2203  inner-membrane translocator  34.05 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0779  inner-membrane translocator  34.75 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
318 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  33.89 
 
 
332 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  33.08 
 
 
317 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  33.13 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  29.75 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  30.75 
 
 
407 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.19 
 
 
415 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
326 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  32.43 
 
 
355 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 
357 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  31.32 
 
 
324 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  33.46 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  36.63 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  33.46 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  34.9 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4906  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3829  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  31.62 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.99 
 
 
297 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  30.22 
 
 
318 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  28.94 
 
 
335 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  32.48 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.21 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  29.09 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  33.22 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.22 
 
 
350 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  31.58 
 
 
319 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  27.6 
 
 
343 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  30.27 
 
 
562 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  32.83 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  33.1 
 
 
327 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  30.88 
 
 
319 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  30.36 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  30.71 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  33.46 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  28.23 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  32.68 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  35.84 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3966  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  30.9 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  35.84 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  31.08 
 
 
352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  35.84 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  33.47 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 
298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  30.29 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.69 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  32.71 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  32.17 
 
 
350 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
282 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  30.71 
 
 
345 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  31.85 
 
 
330 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>