More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0468 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  70.67 
 
 
525 aa  781    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  99.24 
 
 
525 aa  1078    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  62.1 
 
 
526 aa  674    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  71.81 
 
 
525 aa  791    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  62.67 
 
 
529 aa  691    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  70.48 
 
 
525 aa  780    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  89.9 
 
 
525 aa  981    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  100 
 
 
525 aa  1090    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  62.48 
 
 
529 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  63.02 
 
 
529 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  50.47 
 
 
533 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  48.27 
 
 
532 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  45.7 
 
 
552 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  45.51 
 
 
532 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  44.81 
 
 
532 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  45.73 
 
 
535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  45.02 
 
 
532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 
532 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  44.23 
 
 
528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  43.7 
 
 
528 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  44.09 
 
 
528 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  41.78 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 
549 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  41.4 
 
 
526 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  41.75 
 
 
545 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 
544 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  40.12 
 
 
547 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.34 
 
 
543 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  38.22 
 
 
541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  38.73 
 
 
558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  39.19 
 
 
559 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  37.5 
 
 
556 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  38.9 
 
 
556 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.98 
 
 
543 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.98 
 
 
543 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.98 
 
 
543 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.98 
 
 
543 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.78 
 
 
543 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 
561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  37.57 
 
 
547 aa  329  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  37.43 
 
 
543 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  37.52 
 
 
558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  37.52 
 
 
558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.52 
 
 
558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.52 
 
 
558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.43 
 
 
543 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  37.43 
 
 
543 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.43 
 
 
543 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  38.05 
 
 
545 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  38.23 
 
 
545 aa  324  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.52 
 
 
545 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  37.52 
 
 
545 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  35.54 
 
 
543 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.14 
 
 
543 aa  323  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  37.52 
 
 
525 aa  323  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  37.63 
 
 
555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
536 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 
539 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  37.55 
 
 
554 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 
544 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 
533 aa  311  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  37.55 
 
 
538 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  36.48 
 
 
545 aa  306  7e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 
558 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 
534 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  35.82 
 
 
538 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 
538 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  35.82 
 
 
538 aa  302  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
534 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  35.94 
 
 
538 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  34.4 
 
 
544 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  35.44 
 
 
560 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
526 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 
544 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  34.69 
 
 
537 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  34.74 
 
 
545 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  34.56 
 
 
535 aa  289  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  35.66 
 
 
537 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  35.66 
 
 
537 aa  289  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  35.66 
 
 
537 aa  289  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  35.56 
 
 
537 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  35.66 
 
 
537 aa  289  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 
537 aa  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  35.66 
 
 
537 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.56 
 
 
550 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  35.66 
 
 
537 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  35.95 
 
 
538 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 
542 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  35.66 
 
 
537 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  33.52 
 
 
544 aa  286  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.72 
 
 
537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.29 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.29 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.29 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.29 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.29 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.29 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.29 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  32.97 
 
 
535 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>