291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0293 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0317  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
329 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  93.92 
 
 
328 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0293  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
329 aa  681    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.078094  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3497  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.06 
 
 
324 aa  607  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3792  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.23 
 
 
324 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7388  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  86.02 
 
 
329 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3724  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  82.45 
 
 
323 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1062  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  83.44 
 
 
323 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3537  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  82.8 
 
 
323 aa  541  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.239174  hitchhiker  0.00144098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3134  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  82.8 
 
 
320 aa  541  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.664044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1145  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  83.12 
 
 
320 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1116  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  82.8 
 
 
323 aa  541  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2116  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.75 
 
 
324 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000335276 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0358  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.71 
 
 
324 aa  538  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4378  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  80.63 
 
 
329 aa  534  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677637  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1751  Ribonucleoside-diphosphate reductase  79.3 
 
 
325 aa  531  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.179063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0518  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.08 
 
 
338 aa  532  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.48 
 
 
324 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3288  Ribonucleoside-diphosphate reductase  78.8 
 
 
334 aa  528  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0806  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.39 
 
 
323 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2950  Ribonucleoside-diphosphate reductase  77.85 
 
 
334 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10210  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  77.85 
 
 
325 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4286  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.71 
 
 
320 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.439345  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3156  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.3 
 
 
319 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.245753  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0380  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.09 
 
 
326 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2060  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.34 
 
 
324 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0099  Ribonucleoside-diphosphate reductase  77.22 
 
 
326 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0986719  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13064  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.07 
 
 
324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0902042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1809  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.07 
 
 
320 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152491  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1828  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.07 
 
 
320 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1875  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.07 
 
 
320 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.114805  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2925  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.66 
 
 
319 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2956  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.66 
 
 
319 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.01741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3008  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.66 
 
 
319 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0450  Ribonucleoside-diphosphate reductase  76.75 
 
 
326 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2991  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.66 
 
 
319 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.02246 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2798  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.53 
 
 
319 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.01423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3203  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.22 
 
 
319 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3114  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.34 
 
 
319 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2812  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.22 
 
 
319 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4465  Ribonucleoside-diphosphate reductase  74.68 
 
 
326 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1030  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.22 
 
 
319 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.489101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02532  ribonucleotide-diphosphate reductase beta subunit  76.9 
 
 
319 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1007  Ribonucleoside-diphosphate reductase  76.9 
 
 
319 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00862585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3920  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  76.9 
 
 
319 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02496  hypothetical protein  76.9 
 
 
319 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10500  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  75.48 
 
 
323 aa  502  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2957  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  76.9 
 
 
319 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2436  Ribonucleoside-diphosphate reductase  75.48 
 
 
326 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.788989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1011  Ribonucleoside-diphosphate reductase  74.68 
 
 
320 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1464  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  71.97 
 
 
330 aa  484  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24870  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib beta subunit  69.52 
 
 
322 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.375933  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12012  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  66.56 
 
 
322 aa  447  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0176  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  58.54 
 
 
359 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28100  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  60.51 
 
 
341 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl530  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  52.17 
 
 
340 aa  363  2e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0099  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  52.53 
 
 
339 aa  362  6e-99  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0418  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  50.46 
 
 
336 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0818  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  52.08 
 
 
319 aa  343  2e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1249  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  50.8 
 
 
320 aa  338  7e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0256  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  51.75 
 
 
325 aa  332  6e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0141  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  50.65 
 
 
337 aa  326  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0322  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  50.16 
 
 
339 aa  325  7e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1060  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  49.21 
 
 
325 aa  318  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1471  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.54 
 
 
322 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1270  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
322 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3937  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.54 
 
 
322 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.216527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1244  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1406  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.357607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1444  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
322 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1270  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
322 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1242  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
322 aa  245  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.469599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1372  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.23 
 
 
322 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1076  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.69 
 
 
322 aa  238  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3232  hypothetical protein  40.99 
 
 
323 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.259813  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3416  hypothetical protein  40.99 
 
 
323 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0962028  normal  0.690578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0968  ribonucleoside-diphosphate reductase  40.44 
 
 
429 aa  235  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0398  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  39.88 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.804906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0542  Ribonucleoside-diphosphate reductase  37.19 
 
 
333 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0756  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  38.89 
 
 
323 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0773  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  38.89 
 
 
323 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.443728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2764  Ribonucleoside-diphosphate reductase  37.69 
 
 
331 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1775  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  35.79 
 
 
319 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0127237  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1510  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  35.98 
 
 
340 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0531925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1705  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  31.65 
 
 
320 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000140789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1511  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  38.86 
 
 
193 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1513  ribonucleoside-diphosphate reductase, subunit beta  44.78 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1696  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.64 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.371216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1700  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.74 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3222  ribonucleoside-diphosphate reductase  26.17 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.74 
 
 
344 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.74 
 
 
344 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0049  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.08 
 
 
340 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0596  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.69 
 
 
346 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02898  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.61 
 
 
347 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0335  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.83 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2288  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.26 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.439269  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0475  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.45 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0538  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.45 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5334  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.7 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>